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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.523463Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1080 / 3316537 1207 / 2498449 288151 / 114162531 287230 / 109592465 1080 / 3316537 1207 / 2498449 288151 / 114162531 287230 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 8 / 16077 29 / 57865 -- 11 / 83577 8 / 16077 29 / 57865 -- 11 / 83577
bone marrow 5 / 14774 24 / 29891 7456 / 5047110 9593 / 4978364 5 / 14774 24 / 29891 7456 / 5047110 9593 / 4978364
brain 44 / 506301 52 / 200215 680 / 729526 13014 / 4997811 44 / 506301 52 / 200215 680 / 729526 13014 / 4997811
cartilage 2 / 15965 25 / 37226 -- 456 / 778035 2 / 15965 25 / 37226 -- 456 / 778035
cerebellum 6 / 90353   94 / 90885 4845 / 1495938 6 / 90353 0 / 0 94 / 90885 4845 / 1495938
cerebrum 30 / 198932   -- -- 30 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 11 / 44577 -- -- 1 / 3888 11 / 44577 -- --
colon 5 / 26551 135 / 151167 59 / 98089 935 / 643586 5 / 26551 135 / 151167 59 / 98089 935 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 145 / 246043   -- -- 145 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 7 / 19564   -- -- 7 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 48 / 128826 15 / 46440 117 / 85898 8651 / 12434232 48 / 128826 15 / 46440 117 / 85898 8651 / 12434232
gastrointestinal tract 12 / 28803 1 / 12721 39 / 45908 -- 12 / 28803 1 / 12721 39 / 45908 --
heart 92 / 76442   223 / 83063 -- 92 / 76442 0 / 1 223 / 83063 --
kidney 16 / 106627 54 / 89898 216 / 155372 272 / 100281 16 / 106627 54 / 89898 216 / 155372 272 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 50 / 96846 31 / 107249 100 / 66308 1406 / 214987 50 / 96846 31 / 107249 100 / 66308 1406 / 214987
lung 63 / 128150 133 / 170663 684 / 159917 417 / 159059 63 / 128150 133 / 170663 684 / 159917 417 / 159059
lymph node 9 / 62650 30 / 27007 73011 / 5278419 78171 / 4863489 9 / 62650 30 / 27007 73011 / 5278419 78171 / 4863489
lymphoreticular 34 / 17836 47 / 44303 -- -- 34 / 17836 47 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 37 / 104307 15345 / 43166038 90189 / 30312656 2 / 46553 37 / 104307 15345 / 43166038 90189 / 30312656
muscle 12 / 74039 17 / 27691 135 / 107836 204 / 61270 12 / 74039 17 / 27691 135 / 107836 204 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 9 / 11462 45 / 89988 240 / 94887 271 / 179472 9 / 11462 45 / 89988 240 / 94887 271 / 179472
pancreas 1 / 7237 33 / 74930 211 / 85728 403 / 189999 1 / 7237 33 / 74930 211 / 85728 403 / 189999
pancreatic islet 18 / 96524 22 / 30072 -- -- 18 / 96524 22 / 30072 -- --
parathyroid   16 / 20557 -- -- 0 / 24 16 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 7 / 6170 -- -- -- 7 / 6170 -- -- --
pituitary gland 7 / 13260   -- -- 7 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 31 / 241088 15 / 39531 818 / 207348 -- 31 / 241088 15 / 39531 818 / 207348 --
pooled tissue 130 / 276455   -- -- 130 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 73 / 79993 171 / 107080 2190 / 266949 1954 / 491794 73 / 79993 171 / 107080 2190 / 266949 1954 / 491794
retina 6 / 29438 -- 1086 / 820326 150 / 88490 6 / 29438 -- 1086 / 820326 150 / 88490
salivary gland 1 / 2490 7 / 10368 -- -- 1 / 2490 7 / 10368 -- --
skin 17 / 73633 72 / 125377 75057 / 26905847 46219 / 34522313 17 / 73633 72 / 125377 75057 / 26905847 46219 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 14 / 52939   -- -- 14 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 10670 / 6230144 -- -- -- 10670 / 6230144 --
stomach 9 / 26641 7 / 65644 266 / 124767 835 / 448716 9 / 26641 7 / 65644 266 / 124767 835 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 11 / 143630 35 / 100058 -- 28382 / 12372003 11 / 143630 35 / 100058 -- 28382 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 6 / 32606 493 / 115938 553 / 124664 3 / 11737 6 / 32606 493 / 115938 553 / 124664
uncharacterized tissue 88 / 207932 93 / 479819 132 / 21833 299 / 51729 88 / 207932 93 / 479819 132 / 21833 299 / 51729
uterus 28 / 38063 38 / 133582 59867 / 10193077 -- 28 / 38063 38 / 133582 59867 / 10193077 --
vascular 29 / 46250 -- 37098 / 13135050 -- 29 / 46250 -- 37098 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1864 / 846268 -- -- -- 1864 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --