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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.523302Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 832 / 3316537 813 / 2498449 1109 / 114162531 3761 / 109592465 832 / 3316537 813 / 2498449 1109 / 114162531 3761 / 109592465
adrenal cortex -- 8 / 9928 -- -- -- 8 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   13 / 57865 --   0 / 16077 13 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 11 / 14774 92 / 29891 42 / 5047110 149 / 4978364 11 / 14774 92 / 29891 42 / 5047110 149 / 4978364
brain 59 / 506301 51 / 200215 28 / 729526 204 / 4997811 59 / 506301 51 / 200215 28 / 729526 204 / 4997811
cartilage   8 / 37226 -- 33 / 778035 0 / 15965 8 / 37226 -- 33 / 778035
cerebellum 5 / 90353   1 / 90885 43 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 1 / 90885 43 / 1495938
cerebrum 15 / 198932   -- -- 15 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   10 / 44577 -- -- 0 / 3888 10 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 43 / 151167 1 / 98089 37 / 643586 3 / 26551 43 / 151167 1 / 98089 37 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 65 / 246043   -- -- 65 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 11 / 19564 5 / 2857 -- -- 11 / 19564 5 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 15 / 128826 9 / 46440 6 / 85898 191 / 12434232 15 / 128826 9 / 46440 6 / 85898 191 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803 2 / 12721 1 / 45908 -- 4 / 28803 2 / 12721 1 / 45908 --
heart 9 / 76442   11 / 83063 -- 9 / 76442 0 / 1 11 / 83063 --
kidney 77 / 106627 32 / 89898 8 / 155372   77 / 106627 32 / 89898 8 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 62 / 96846 30 / 107249 5 / 66308 6 / 214987 62 / 96846 30 / 107249 5 / 66308 6 / 214987
lung 45 / 128150 25 / 170663 1 / 159917 6 / 159059 45 / 128150 25 / 170663 1 / 159917 6 / 159059
lymph node 7 / 62650 5 / 27007 39 / 5278419 231 / 4863489 7 / 62650 5 / 27007 39 / 5278419 231 / 4863489
lymphoreticular 2 / 17836 6 / 44303 -- -- 2 / 17836 6 / 44303 -- --
mammary gland   11 / 104307 161 / 43166038 1418 / 30312656 0 / 46553 11 / 104307 161 / 43166038 1418 / 30312656
muscle 57 / 74039   4 / 107836   57 / 74039 0 / 27691 4 / 107836 0 / 61270
nervous 3 / 10333   -- -- 3 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 7 / 11462 5 / 89988 5 / 94887 8 / 179472 7 / 11462 5 / 89988 5 / 94887 8 / 179472
pancreas   14 / 74930 6 / 85728 9 / 189999 0 / 7237 14 / 74930 6 / 85728 9 / 189999
pancreatic islet 25 / 96524 5 / 30072 -- -- 25 / 96524 5 / 30072 -- --
parathyroid   11 / 20557 -- -- 0 / 24 11 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 11 / 13260   -- -- 11 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 59 / 241088 9 / 39531 4 / 207348 -- 59 / 241088 9 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 62 / 276455   -- -- 62 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 18 / 79993 47 / 107080 14 / 266949 54 / 491794 18 / 79993 47 / 107080 14 / 266949 54 / 491794
retina   -- 14 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 14 / 820326 1 / 88490
salivary gland 2 / 2490   -- -- 2 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 19 / 73633 43 / 125377 114 / 26905847 462 / 34522313 19 / 73633 43 / 125377 114 / 26905847 462 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 194 / 6230144 -- -- -- 194 / 6230144 --
stomach   10 / 65644 9 / 124767 20 / 448716 0 / 26641 10 / 65644 9 / 124767 20 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 16 / 143630 126 / 100058 -- 875 / 12372003 16 / 143630 126 / 100058 -- 875 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 9 / 32606 9 / 115938 10 / 124664 1 / 11737 9 / 32606 9 / 115938 10 / 124664
uncharacterized tissue 124 / 207932 146 / 479819   4 / 51729 124 / 207932 146 / 479819 0 / 21833 4 / 51729
uterus 10 / 38063 38 / 133582 194 / 10193077 -- 10 / 38063 38 / 133582 194 / 10193077 --
vascular 15 / 46250 -- 198 / 13135050 -- 15 / 46250 -- 198 / 13135050 --
white blood cells -- -- 40 / 846268 -- -- -- 40 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --