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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.523009Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 222 / 3316537 125 / 2498449 680 / 114162531 1147 / 109592465 222 / 3316537 125 / 2498449 680 / 114162531 1147 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077   --   1 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     5 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 5 / 5047110 0 / 4978364
brain 62 / 506301 36 / 200215 83 / 729526 593 / 4997811 62 / 506301 36 / 200215 83 / 729526 593 / 4997811
cartilage   6 / 37226 --   0 / 15965 6 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 18 / 90353   34 / 90885 92 / 1495938 18 / 90353 0 / 0 34 / 90885 92 / 1495938
cerebrum 24 / 198932   -- -- 24 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 2 / 151167   1 / 643586 1 / 26551 2 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 10 / 128826 1 / 46440 3 / 85898 141 / 12434232 10 / 128826 1 / 46440 3 / 85898 141 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 3 / 106627 2 / 89898 60 / 155372 1 / 100281 3 / 106627 2 / 89898 60 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   1 / 107249     0 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 9 / 128150 7 / 170663 12 / 159917   9 / 128150 7 / 170663 12 / 159917 0 / 159059
lymph node 5 / 62650 1 / 27007 94 / 5278419 10 / 4863489 5 / 62650 1 / 27007 94 / 5278419 10 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 3 / 44303 -- -- 1 / 17836 3 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 61 / 43166038 88 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 61 / 43166038 88 / 30312656
muscle   3 / 27691 1 / 107836   0 / 74039 3 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous 5 / 10333   -- -- 5 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 14 / 89988   2 / 179472 1 / 11462 14 / 89988 0 / 94887 2 / 179472
pancreas   3 / 74930     0 / 7237 3 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524 2 / 30072 -- -- 3 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 11 / 14891   -- -- 11 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland   1 / 1358 -- -- 0 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta     1 / 207348 -- 0 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 10 / 276455   -- -- 10 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993   1 / 266949   5 / 79993 0 / 107080 1 / 266949 0 / 491794
retina 9 / 29438 -- 160 / 820326   9 / 29438 -- 160 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   1 / 125377 79 / 26905847 210 / 34522313 0 / 73633 1 / 125377 79 / 26905847 210 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 4 / 52939   -- -- 4 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 4 / 6230144 -- -- -- 4 / 6230144 --
stomach   3 / 65644   3 / 448716 0 / 26641 3 / 65644 0 / 124767 3 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 16 / 143630 2 / 100058 -- 6 / 12372003 16 / 143630 2 / 100058 -- 6 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   3 / 32606 1 / 115938   0 / 11737 3 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 18 / 207932 15 / 479819     18 / 207932 15 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   16 / 133582 66 / 10193077 -- 0 / 38063 16 / 133582 66 / 10193077 --
vascular   --   -- 0 / 46250 -- 0 / 13135050 --
white blood cells -- -- 14 / 846268 -- -- -- 14 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --