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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.522373Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1289 / 3316537 791 / 2498449 23940 / 114162531 4841 / 109592465 1289 / 3316537 791 / 2498449 23940 / 114162531 4841 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 12 / 16077 3 / 57865 -- 170 / 83577 12 / 16077 3 / 57865 -- 170 / 83577
bone marrow 2 / 14774 17 / 29891 23 / 5047110 23 / 4978364 2 / 14774 17 / 29891 23 / 5047110 23 / 4978364
brain 233 / 506301 55 / 200215 148 / 729526 1800 / 4997811 233 / 506301 55 / 200215 148 / 729526 1800 / 4997811
cartilage 21 / 15965 12 / 37226 -- 294 / 778035 21 / 15965 12 / 37226 -- 294 / 778035
cerebellum 15 / 90353   6 / 90885 126 / 1495938 15 / 90353 0 / 0 6 / 90885 126 / 1495938
cerebrum 170 / 198932   -- -- 170 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 3 / 3888 3 / 44577 -- -- 3 / 3888 3 / 44577 -- --
colon 18 / 26551 57 / 151167 193 / 98089 57 / 643586 18 / 26551 57 / 151167 193 / 98089 57 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 28 / 246043   -- -- 28 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564   -- -- 4 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   8 / 17290 -- -- 0 / 270 8 / 17290 -- --
eye 66 / 128826   18 / 85898 32 / 12434232 66 / 128826 0 / 46440 18 / 85898 32 / 12434232
gastrointestinal tract 52 / 28803 1 / 12721 5 / 45908 -- 52 / 28803 1 / 12721 5 / 45908 --
heart 43 / 76442   74 / 83063 -- 43 / 76442 0 / 1 74 / 83063 --
kidney 50 / 106627 45 / 89898 22 / 155372 15 / 100281 50 / 106627 45 / 89898 22 / 155372 15 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 10 / 107249 1 / 66308 10 / 214987 5 / 96846 10 / 107249 1 / 66308 10 / 214987
lung 37 / 128150 15 / 170663 40 / 159917 36 / 159059 37 / 128150 15 / 170663 40 / 159917 36 / 159059
lymph node 7 / 62650 6 / 27007 429 / 5278419 2 / 4863489 7 / 62650 6 / 27007 429 / 5278419 2 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836   -- -- 1 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 17 / 46553 33 / 104307 20079 / 43166038 1053 / 30312656 17 / 46553 33 / 104307 20079 / 43166038 1053 / 30312656
muscle 26 / 74039 1 / 27691 41 / 107836 8 / 61270 26 / 74039 1 / 27691 41 / 107836 8 / 61270
nervous 10 / 10333   -- -- 10 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 4 / 11462 15 / 89988 7 / 94887 31 / 179472 4 / 11462 15 / 89988 7 / 94887 31 / 179472
pancreas   42 / 74930 2 / 85728 45 / 189999 0 / 7237 42 / 74930 2 / 85728 45 / 189999
pancreatic islet 22 / 96524 37 / 30072 -- -- 22 / 96524 37 / 30072 -- --
parathyroid   10 / 20557 -- -- 0 / 24 10 / 20557 -- --
peripheral nervous system 10 / 14891   -- -- 10 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 46 / 241088   21 / 207348 -- 46 / 241088 0 / 39531 21 / 207348 --
pooled tissue 46 / 276455   -- -- 46 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 38 / 79993 12 / 107080 70 / 266949 28 / 491794 38 / 79993 12 / 107080 70 / 266949 28 / 491794
retina 14 / 29438 -- 81 / 820326 2 / 88490 14 / 29438 -- 81 / 820326 2 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 31 / 73633 119 / 125377 679 / 26905847 935 / 34522313 31 / 73633 119 / 125377 679 / 26905847 935 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 35 / 52939   -- -- 35 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 42 / 6230144 -- -- -- 42 / 6230144 --
stomach 23 / 26641 33 / 65644 12 / 124767 99 / 448716 23 / 26641 33 / 65644 12 / 124767 99 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 22 / 143630 10 / 100058 -- 58 / 12372003 22 / 143630 10 / 100058 -- 58 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 14 / 11737 12 / 32606 81 / 115938 13 / 124664 14 / 11737 12 / 32606 81 / 115938 13 / 124664
uncharacterized tissue 79 / 207932 202 / 479819 3 / 21833 4 / 51729 79 / 207932 202 / 479819 3 / 21833 4 / 51729
uterus 11 / 38063 28 / 133582 1664 / 10193077 -- 11 / 38063 28 / 133582 1664 / 10193077 --
vascular 21 / 46250 -- 131 / 13135050 -- 21 / 46250 -- 131 / 13135050 --
white blood cells -- -- 68 / 846268 -- -- -- 68 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --