Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.522114Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 349 / 3316537 553 / 2498449 7616 / 114162531 10607 / 109592465 349 / 3316537 553 / 2498449 7616 / 114162531 10607 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 9 / 57865 -- 10 / 83577 2 / 16077 9 / 57865 -- 10 / 83577
bone marrow 1 / 14774   59 / 5047110 89 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 59 / 5047110 89 / 4978364
brain 35 / 506301 43 / 200215 54 / 729526 512 / 4997811 35 / 506301 43 / 200215 54 / 729526 512 / 4997811
cartilage   7 / 37226 -- 122 / 778035 0 / 15965 7 / 37226 -- 122 / 778035
cerebellum 5 / 90353   4 / 90885 160 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 4 / 90885 160 / 1495938
cerebrum 15 / 198932   -- -- 15 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   8 / 44577 -- -- 0 / 3888 8 / 44577 -- --
colon 4 / 26551 28 / 151167 4 / 98089 32 / 643586 4 / 26551 28 / 151167 4 / 98089 32 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 42 / 246043   -- -- 42 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564 1 / 2857 -- -- 1 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 29 / 128826 8 / 46440 5 / 85898 600 / 12434232 29 / 128826 8 / 46440 5 / 85898 600 / 12434232
gastrointestinal tract   2 / 12721   -- 0 / 28803 2 / 12721 0 / 45908 --
heart 6 / 76442   5 / 83063 -- 6 / 76442 0 / 1 5 / 83063 --
kidney 3 / 106627 26 / 89898 13 / 155372 25 / 100281 3 / 106627 26 / 89898 13 / 155372 25 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 13 / 107249 5 / 66308 14 / 214987 1 / 96846 13 / 107249 5 / 66308 14 / 214987
lung 24 / 128150 45 / 170663 22 / 159917 7 / 159059 24 / 128150 45 / 170663 22 / 159917 7 / 159059
lymph node 15 / 62650 8 / 27007 551 / 5278419 288 / 4863489 15 / 62650 8 / 27007 551 / 5278419 288 / 4863489
lymphoreticular 3 / 17836 34 / 44303 -- -- 3 / 17836 34 / 44303 -- --
mammary gland 5 / 46553 25 / 104307 2434 / 43166038 5251 / 30312656 5 / 46553 25 / 104307 2434 / 43166038 5251 / 30312656
muscle 3 / 74039 5 / 27691 2 / 107836   3 / 74039 5 / 27691 2 / 107836 0 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 4 / 11462 24 / 89988 9 / 94887 23 / 179472 4 / 11462 24 / 89988 9 / 94887 23 / 179472
pancreas 4 / 7237 25 / 74930 3 / 85728 32 / 189999 4 / 7237 25 / 74930 3 / 85728 32 / 189999
pancreatic islet 12 / 96524 5 / 30072 -- -- 12 / 96524 5 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system 5 / 14891   -- -- 5 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 21 / 241088 35 / 39531 37 / 207348 -- 21 / 241088 35 / 39531 37 / 207348 --
pooled tissue 43 / 276455   -- -- 43 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 9 / 79993 15 / 107080 31 / 266949 49 / 491794 9 / 79993 15 / 107080 31 / 266949 49 / 491794
retina 2 / 29438 -- 93 / 820326 9 / 88490 2 / 29438 -- 93 / 820326 9 / 88490
salivary gland   12 / 10368 -- -- 0 / 2490 12 / 10368 -- --
skin 13 / 73633 69 / 125377 923 / 26905847 1230 / 34522313 13 / 73633 69 / 125377 923 / 26905847 1230 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 416 / 6230144 -- -- -- 416 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 5 / 65644 4 / 124767 44 / 448716 1 / 26641 5 / 65644 4 / 124767 44 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 9 / 143630 19 / 100058 -- 2079 / 12372003 9 / 143630 19 / 100058 -- 2079 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     13 / 115938 29 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 13 / 115938 29 / 124664
uncharacterized tissue 16 / 207932 37 / 479819 1 / 21833 2 / 51729 16 / 207932 37 / 479819 1 / 21833 2 / 51729
uterus 5 / 38063 40 / 133582 1114 / 10193077 -- 5 / 38063 40 / 133582 1114 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 1768 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 1768 / 13135050 --
white blood cells -- -- 46 / 846268 -- -- -- 46 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --