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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.521954Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 115 / 3316537 134 / 2498449 1487 / 114162531 1354 / 109592465 115 / 3316537 134 / 2498449 1487 / 114162531 1354 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   1 / 29891 1 / 5047110 24 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 1 / 5047110 24 / 4978364
brain 11 / 506301 17 / 200215 14 / 729526 75 / 4997811 11 / 506301 17 / 200215 14 / 729526 75 / 4997811
cartilage     -- 8 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 8 / 778035
cerebellum 2 / 90353   3 / 90885 13 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 3 / 90885 13 / 1495938
cerebrum 2 / 198932   -- -- 2 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 4 / 26551 13 / 151167 18 / 98089 25 / 643586 4 / 26551 13 / 151167 18 / 98089 25 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 5 / 246043   -- -- 5 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 11 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 36 / 12434232 11 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 36 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 -- 1 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 --
heart 1 / 76442   1 / 83063 -- 1 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney   1 / 89898 4 / 155372 1 / 100281 0 / 106627 1 / 89898 4 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 2 / 107249   4 / 214987 3 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 4 / 214987
lung 6 / 128150 4 / 170663 5 / 159917 6 / 159059 6 / 128150 4 / 170663 5 / 159917 6 / 159059
lymph node   1 / 27007 121 / 5278419 4 / 4863489 0 / 62650 1 / 27007 121 / 5278419 4 / 4863489
lymphoreticular   8 / 44303 -- -- 0 / 17836 8 / 44303 -- --
mammary gland 6 / 46553 2 / 104307 768 / 43166038 807 / 30312656 6 / 46553 2 / 104307 768 / 43166038 807 / 30312656
muscle 2 / 74039   1 / 107836 1 / 61270 2 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   13 / 89988   4 / 179472 0 / 11462 13 / 89988 0 / 94887 4 / 179472
pancreas   3 / 74930 9 / 85728 15 / 189999 0 / 7237 3 / 74930 9 / 85728 15 / 189999
pancreatic islet   6 / 30072 -- -- 0 / 96524 6 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 12 / 241088 1 / 39531   -- 12 / 241088 1 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 17 / 276455   -- -- 17 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 7 / 107080 3 / 266949 8 / 491794 6 / 79993 7 / 107080 3 / 266949 8 / 491794
retina   -- 4 / 820326   0 / 29438 -- 4 / 820326 0 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin   7 / 125377 155 / 26905847 267 / 34522313 0 / 73633 7 / 125377 155 / 26905847 267 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 28 / 6230144 -- -- -- 28 / 6230144 --
stomach 4 / 26641 13 / 65644 1 / 124767 25 / 448716 4 / 26641 13 / 65644 1 / 124767 25 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630   -- 31 / 12372003 5 / 143630 0 / 100058 -- 31 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606     0 / 11737 1 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 13 / 207932 25 / 479819     13 / 207932 25 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   6 / 133582 187 / 10193077 -- 0 / 38063 6 / 133582 187 / 10193077 --
vascular   -- 148 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 148 / 13135050 --
white blood cells -- -- 13 / 846268 -- -- -- 13 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --