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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.520348Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 9441 / 3316537 4046 / 2498449 213 / 114162531 554 / 109592465 9441 / 3316537 4046 / 2498449 213 / 114162531 554 / 109592465
adrenal cortex -- 11 / 9928 -- -- -- 11 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 49 / 57865 --   1 / 16077 49 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 19 / 14774 34 / 29891 27 / 5047110 6 / 4978364 19 / 14774 34 / 29891 27 / 5047110 6 / 4978364
brain 1929 / 506301 622 / 200215 4 / 729526 26 / 4997811 1929 / 506301 622 / 200215 4 / 729526 26 / 4997811
cartilage 251 / 15965 27 / 37226 -- 8 / 778035 251 / 15965 27 / 37226 -- 8 / 778035
cerebellum 724 / 90353     6 / 1495938 724 / 90353 0 / 0 0 / 90885 6 / 1495938
cerebrum 712 / 198932 5 / 3422 -- -- 712 / 198932 5 / 3422 -- --
cervix 31 / 3888 71 / 44577 -- -- 31 / 3888 71 / 44577 -- --
colon 93 / 26551 92 / 151167   2 / 643586 93 / 26551 92 / 151167 0 / 98089 2 / 643586
ear 10 / 16130 -- -- -- 10 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 146 / 246043   -- -- 146 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 153 / 19564 2 / 2857 -- -- 153 / 19564 2 / 2857 -- --
esophagus 1 / 270 96 / 17290 -- -- 1 / 270 96 / 17290 -- --
eye 47 / 128826 34 / 46440   25 / 12434232 47 / 128826 34 / 46440 0 / 85898 25 / 12434232
gastrointestinal tract 308 / 28803 3 / 12721   -- 308 / 28803 3 / 12721 0 / 45908 --
heart 210 / 76442     -- 210 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 353 / 106627 194 / 89898 1 / 155372   353 / 106627 194 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 41 / 96846 163 / 107249   1 / 214987 41 / 96846 163 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 483 / 128150 122 / 170663   1 / 159059 483 / 128150 122 / 170663 0 / 159917 1 / 159059
lymph node 4 / 62650 15 / 27007 13 / 5278419 4 / 4863489 4 / 62650 15 / 27007 13 / 5278419 4 / 4863489
lymphoreticular 3 / 17836 16 / 44303 -- -- 3 / 17836 16 / 44303 -- --
mammary gland 58 / 46553 148 / 104307 10 / 43166038 165 / 30312656 58 / 46553 148 / 104307 10 / 43166038 165 / 30312656
muscle 76 / 74039 7 / 27691     76 / 74039 7 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 41 / 10333   -- -- 41 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 16 / 11462 99 / 89988   1 / 179472 16 / 11462 99 / 89988 0 / 94887 1 / 179472
pancreas 2 / 7237 72 / 74930   2 / 189999 2 / 7237 72 / 74930 0 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 47 / 96524 23 / 30072 -- -- 47 / 96524 23 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system 39 / 14891   -- -- 39 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 5 / 13260 2 / 1358 -- -- 5 / 13260 2 / 1358 -- --
placenta 349 / 241088 9 / 39531   -- 349 / 241088 9 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 35 / 276455   -- -- 35 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 292 / 79993 29 / 107080   1 / 491794 292 / 79993 29 / 107080 0 / 266949 1 / 491794
retina 17 / 29438 -- 3 / 820326   17 / 29438 -- 3 / 820326 0 / 88490
salivary gland 1 / 2490 2 / 10368 -- -- 1 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 89 / 73633 72 / 125377 58 / 26905847 245 / 34522313 89 / 73633 72 / 125377 58 / 26905847 245 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 507 / 52939   -- -- 507 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 53 / 6230144 -- -- -- 53 / 6230144 --
stomach 72 / 26641 78 / 65644   4 / 448716 72 / 26641 78 / 65644 0 / 124767 4 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1035 / 143630 304 / 100058 -- 56 / 12372003 1035 / 143630 304 / 100058 -- 56 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 67 / 11737 8 / 32606 1 / 115938 1 / 124664 67 / 11737 8 / 32606 1 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 896 / 207932 1408 / 479819     896 / 207932 1408 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 74 / 38063 225 / 133582 23 / 10193077 -- 74 / 38063 225 / 133582 23 / 10193077 --
vascular 178 / 46250 -- 20 / 13135050 -- 178 / 46250 -- 20 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --