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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.520046Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 99 / 3316537 55 / 2498449 1018 / 114162531 751 / 109592465 99 / 3316537 55 / 2498449 1018 / 114162531 751 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 1 / 57865 -- 7 / 83577 1 / 16077 1 / 57865 -- 7 / 83577
bone marrow     23 / 5047110 28 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 23 / 5047110 28 / 4978364
brain 5 / 506301 3 / 200215 7 / 729526 72 / 4997811 5 / 506301 3 / 200215 7 / 729526 72 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 16 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 16 / 778035
cerebellum     1 / 90885 8 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 8 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 5 / 151167   1 / 643586 3 / 26551 5 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 4 / 246043   -- -- 4 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 4 / 128826     20 / 12434232 4 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 20 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 6 / 76442   2 / 83063 -- 6 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 3 / 106627 1 / 89898 2 / 155372   3 / 106627 1 / 89898 2 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   1 / 107249   1 / 214987 0 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 8 / 128150 6 / 170663 2 / 159917 8 / 159059 8 / 128150 6 / 170663 2 / 159917 8 / 159059
lymph node 7 / 62650   207 / 5278419 24 / 4863489 7 / 62650 0 / 27007 207 / 5278419 24 / 4863489
lymphoreticular 4 / 17836 3 / 44303 -- -- 4 / 17836 3 / 44303 -- --
mammary gland     227 / 43166038 187 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 227 / 43166038 187 / 30312656
muscle       1 / 61270 0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   3 / 89988 2 / 94887 9 / 179472 0 / 11462 3 / 89988 2 / 94887 9 / 179472
pancreas   2 / 74930   8 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 0 / 85728 8 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524   -- -- 1 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088   1 / 207348 -- 3 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 18 / 276455   -- -- 18 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   1 / 107080 1 / 266949 2 / 491794 0 / 79993 1 / 107080 1 / 266949 2 / 491794
retina   -- 1 / 820326   0 / 29438 -- 1 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   10 / 125377 114 / 26905847 295 / 34522313 0 / 73633 10 / 125377 114 / 26905847 295 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 7 / 52939   -- -- 7 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 23 / 6230144 -- -- -- 23 / 6230144 --
stomach   1 / 65644 2 / 124767 3 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 2 / 124767 3 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630   -- 59 / 12372003 1 / 143630 0 / 100058 -- 59 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 21 / 207932 14 / 479819   2 / 51729 21 / 207932 14 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus   2 / 133582 38 / 10193077 -- 0 / 38063 2 / 133582 38 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 122 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 122 / 13135050 --
white blood cells -- -- 243 / 846268 -- -- -- 243 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --