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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.518123Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 471 / 3316537 578 / 2498449 19168 / 114162531 26834 / 109592465 471 / 3316537 578 / 2498449 19168 / 114162531 26834 / 109592465
adrenal cortex -- 5 / 9928 -- -- -- 5 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   15 / 57865 --   0 / 16077 15 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 2 / 14774 7 / 29891 26 / 5047110 117 / 4978364 2 / 14774 7 / 29891 26 / 5047110 117 / 4978364
brain 66 / 506301 40 / 200215 24 / 729526 400 / 4997811 66 / 506301 40 / 200215 24 / 729526 400 / 4997811
cartilage 6 / 15965 2 / 37226 -- 33 / 778035 6 / 15965 2 / 37226 -- 33 / 778035
cerebellum 22 / 90353   2 / 90885 83 / 1495938 22 / 90353 0 / 0 2 / 90885 83 / 1495938
cerebrum 16 / 198932   -- -- 16 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 3 / 3888 15 / 44577 -- -- 3 / 3888 15 / 44577 -- --
colon 10 / 26551 17 / 151167   59 / 643586 10 / 26551 17 / 151167 0 / 98089 59 / 643586
ear 4 / 16130 -- -- -- 4 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 44 / 246043   -- -- 44 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564   -- -- 3 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 11 / 128826   8 / 85898 7338 / 12434232 11 / 128826 0 / 46440 8 / 85898 7338 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803   2 / 45908 -- 4 / 28803 0 / 12721 2 / 45908 --
heart 12 / 76442   8 / 83063 -- 12 / 76442 0 / 1 8 / 83063 --
kidney 17 / 106627 19 / 89898 18 / 155372 11 / 100281 17 / 106627 19 / 89898 18 / 155372 11 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 26 / 107249 7 / 66308 18 / 214987 1 / 96846 26 / 107249 7 / 66308 18 / 214987
lung 16 / 128150 18 / 170663 16 / 159917 13 / 159059 16 / 128150 18 / 170663 16 / 159917 13 / 159059
lymph node 4 / 62650 8 / 27007 199 / 5278419 84 / 4863489 4 / 62650 8 / 27007 199 / 5278419 84 / 4863489
lymphoreticular 3 / 17836   -- -- 3 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 10 / 46553 20 / 104307 386 / 43166038 5766 / 30312656 10 / 46553 20 / 104307 386 / 43166038 5766 / 30312656
muscle 3 / 74039 5 / 27691 3 / 107836 2 / 61270 3 / 74039 5 / 27691 3 / 107836 2 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 26 / 89988 5 / 94887 11 / 179472 3 / 11462 26 / 89988 5 / 94887 11 / 179472
pancreas 4 / 7237 20 / 74930 6 / 85728 10 / 189999 4 / 7237 20 / 74930 6 / 85728 10 / 189999
pancreatic islet 7 / 96524 3 / 30072 -- -- 7 / 96524 3 / 30072 -- --
parathyroid   10 / 20557 -- -- 0 / 24 10 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 56 / 241088 9 / 39531 29 / 207348 -- 56 / 241088 9 / 39531 29 / 207348 --
pooled tissue 39 / 276455   -- -- 39 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 16 / 107080 24 / 266949 39 / 491794 3 / 79993 16 / 107080 24 / 266949 39 / 491794
retina 3 / 29438 -- 52 / 820326 20 / 88490 3 / 29438 -- 52 / 820326 20 / 88490
salivary gland 2 / 2490 2 / 10368 -- -- 2 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 10 / 73633 19 / 125377 9256 / 26905847 11056 / 34522313 10 / 73633 19 / 125377 9256 / 26905847 11056 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 2390 / 6230144 -- -- -- 2390 / 6230144 --
stomach 4 / 26641 16 / 65644 11 / 124767 41 / 448716 4 / 26641 16 / 65644 11 / 124767 41 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 34 / 143630 13 / 100058 -- 1708 / 12372003 34 / 143630 13 / 100058 -- 1708 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 3 / 32606 15 / 115938 19 / 124664 3 / 11737 3 / 32606 15 / 115938 19 / 124664
uncharacterized tissue 24 / 207932 226 / 479819 1 / 21833 6 / 51729 24 / 207932 226 / 479819 1 / 21833 6 / 51729
uterus 5 / 38063 15 / 133582 597 / 10193077 -- 5 / 38063 15 / 133582 597 / 10193077 --
vascular 9 / 46250 -- 6032 / 13135050 -- 9 / 46250 -- 6032 / 13135050 --
white blood cells -- -- 51 / 846268 -- -- -- 51 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --