Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.517729Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1842 / 3316537 62 / 2498449 54 / 114162531 267 / 109592465 1842 / 3316537 62 / 2498449 54 / 114162531 267 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   7 / 29891 2 / 5047110 22 / 4978364 0 / 14774 7 / 29891 2 / 5047110 22 / 4978364
brain 728 / 506301 23 / 200215 18 / 729526 228 / 4997811 728 / 506301 23 / 200215 18 / 729526 228 / 4997811
cartilage     --   0 / 15965 0 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 492 / 90353   4 / 90885 1 / 1495938 492 / 90353 0 / 0 4 / 90885 1 / 1495938
cerebrum 578 / 198932   -- -- 578 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon         0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 2 / 246043   -- -- 2 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 2 / 128826     7 / 12434232 2 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 7 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney   9 / 89898     0 / 106627 9 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846       2 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung         0 / 128150 0 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node   4 / 27007     0 / 62650 4 / 27007 0 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     26 / 43166038 9 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 26 / 43166038 9 / 30312656
muscle   2 / 27691     0 / 74039 2 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 10 / 241088     -- 10 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 8 / 276455   -- -- 8 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993   1 / 266949   1 / 79993 0 / 107080 1 / 266949 0 / 491794
retina   -- 1 / 820326   0 / 29438 -- 1 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin         0 / 73633 0 / 125377 0 / 26905847 0 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 6230144 --
stomach         0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 4 / 143630 9 / 100058 --   4 / 143630 9 / 100058 -- 0 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 9 / 207932 8 / 479819     9 / 207932 8 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     2 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 2 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 --   -- 1 / 46250 -- 0 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --