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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.517581Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 255 / 3316537 115 / 2498449 49638 / 114162531 13617 / 109592465 255 / 3316537 115 / 2498449 49638 / 114162531 13617 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   4 / 57865 -- 23 / 83577 0 / 16077 4 / 57865 -- 23 / 83577
bone marrow 1 / 14774   6 / 5047110   1 / 14774 0 / 29891 6 / 5047110 0 / 4978364
brain 7 / 506301 12 / 200215 44 / 729526 837 / 4997811 7 / 506301 12 / 200215 44 / 729526 837 / 4997811
cartilage 1 / 15965 1 / 37226 -- 216 / 778035 1 / 15965 1 / 37226 -- 216 / 778035
cerebellum       28 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 28 / 1495938
cerebrum 2 / 198932   -- -- 2 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 1 / 151167 11 / 98089 157 / 643586 3 / 26551 1 / 151167 11 / 98089 157 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 7 / 246043   -- -- 7 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 14 / 128826     191 / 12434232 14 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 191 / 12434232
gastrointestinal tract   4 / 12721 1 / 45908 -- 0 / 28803 4 / 12721 1 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 2 / 106627 10 / 89898 9 / 155372 30 / 100281 2 / 106627 10 / 89898 9 / 155372 30 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 5 / 107249 21 / 66308 5 / 214987 3 / 96846 5 / 107249 21 / 66308 5 / 214987
lung 6 / 128150 6 / 170663 18 / 159917 27 / 159059 6 / 128150 6 / 170663 18 / 159917 27 / 159059
lymph node   2 / 27007 1053 / 5278419 99 / 4863489 0 / 62650 2 / 27007 1053 / 5278419 99 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553   38332 / 43166038 7975 / 30312656 4 / 46553 0 / 104307 38332 / 43166038 7975 / 30312656
muscle 1 / 74039   2 / 107836 15 / 61270 1 / 74039 0 / 27691 2 / 107836 15 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462   4 / 94887 7 / 179472 3 / 11462 0 / 89988 4 / 94887 7 / 179472
pancreas   2 / 74930 1 / 85728 24 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 1 / 85728 24 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524 9 / 30072 -- -- 2 / 96524 9 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 96 / 241088 6 / 39531 56 / 207348 -- 96 / 241088 6 / 39531 56 / 207348 --
pooled tissue 34 / 276455   -- -- 34 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   2 / 107080 2 / 266949 13 / 491794 0 / 79993 2 / 107080 2 / 266949 13 / 491794
retina   -- 12 / 820326 2 / 88490 0 / 29438 -- 12 / 820326 2 / 88490
salivary gland   4 / 10368 -- -- 0 / 2490 4 / 10368 -- --
skin 5 / 73633 6 / 125377 5586 / 26905847 3701 / 34522313 5 / 73633 6 / 125377 5586 / 26905847 3701 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 23 / 52939   -- -- 23 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 130 / 6230144 -- -- -- 130 / 6230144 --
stomach   2 / 65644   13 / 448716 0 / 26641 2 / 65644 0 / 124767 13 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 3 / 100058 -- 251 / 12372003 3 / 143630 3 / 100058 -- 251 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     5 / 115938 1 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 5 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 31 / 207932 24 / 479819 1 / 21833 2 / 51729 31 / 207932 24 / 479819 1 / 21833 2 / 51729
uterus   9 / 133582 1290 / 10193077 -- 0 / 38063 9 / 133582 1290 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 2192 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 2192 / 13135050 --
white blood cells -- -- 862 / 846268 -- -- -- 862 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --