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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.517421Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 331 / 3316537 334 / 2498449 12607 / 114162531 4198 / 109592465 331 / 3316537 334 / 2498449 12607 / 114162531 4198 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 5 / 16077 8 / 57865 -- 7 / 83577 5 / 16077 8 / 57865 -- 7 / 83577
bone marrow   6 / 29891 65 / 5047110 287 / 4978364 0 / 14774 6 / 29891 65 / 5047110 287 / 4978364
brain 69 / 506301 15 / 200215 46 / 729526 260 / 4997811 69 / 506301 15 / 200215 46 / 729526 260 / 4997811
cartilage 2 / 15965 3 / 37226 -- 48 / 778035 2 / 15965 3 / 37226 -- 48 / 778035
cerebellum 14 / 90353   1 / 90885 37 / 1495938 14 / 90353 0 / 0 1 / 90885 37 / 1495938
cerebrum 29 / 198932 1 / 3422 -- -- 29 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 6 / 26551 14 / 151167 3 / 98089 29 / 643586 6 / 26551 14 / 151167 3 / 98089 29 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 12 / 246043   -- -- 12 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564   -- -- 4 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 16 / 128826 4 / 46440 4 / 85898 241 / 12434232 16 / 128826 4 / 46440 4 / 85898 241 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803 2 / 12721   -- 3 / 28803 2 / 12721 0 / 45908 --
heart 5 / 76442   2 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 6 / 106627 12 / 89898 2 / 155372 10 / 100281 6 / 106627 12 / 89898 2 / 155372 10 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 12 / 107249   31 / 214987 3 / 96846 12 / 107249 0 / 66308 31 / 214987
lung 19 / 128150 30 / 170663 12 / 159917 4 / 159059 19 / 128150 30 / 170663 12 / 159917 4 / 159059
lymph node 7 / 62650 3 / 27007 152 / 5278419 8 / 4863489 7 / 62650 3 / 27007 152 / 5278419 8 / 4863489
lymphoreticular 4 / 17836 2 / 44303 -- -- 4 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553 2 / 104307 10808 / 43166038 1037 / 30312656 4 / 46553 2 / 104307 10808 / 43166038 1037 / 30312656
muscle 2 / 74039 1 / 27691 3 / 107836   2 / 74039 1 / 27691 3 / 107836 0 / 61270
nervous 3 / 10333 1 / 8 -- -- 3 / 10333 1 / 8 -- --
ovary   5 / 89988 2 / 94887 6 / 179472 0 / 11462 5 / 89988 2 / 94887 6 / 179472
pancreas   44 / 74930 2 / 85728 21 / 189999 0 / 7237 44 / 74930 2 / 85728 21 / 189999
pancreatic islet 14 / 96524   -- -- 14 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 31 / 241088 6 / 39531 12 / 207348 -- 31 / 241088 6 / 39531 12 / 207348 --
pooled tissue 20 / 276455   -- -- 20 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 10 / 107080 7 / 266949 15 / 491794 6 / 79993 10 / 107080 7 / 266949 15 / 491794
retina 2 / 29438 -- 25 / 820326 1 / 88490 2 / 29438 -- 25 / 820326 1 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 5 / 73633 13 / 125377 553 / 26905847 1834 / 34522313 5 / 73633 13 / 125377 553 / 26905847 1834 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 8 / 52939   -- -- 8 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 58 / 6230144 -- -- -- 58 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 8 / 65644 3 / 124767 16 / 448716 3 / 26641 8 / 65644 3 / 124767 16 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 4 / 143630 17 / 100058 -- 301 / 12372003 4 / 143630 17 / 100058 -- 301 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 6 / 32606 6 / 115938 3 / 124664 2 / 11737 6 / 32606 6 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue 15 / 207932 93 / 479819 4 / 21833 2 / 51729 15 / 207932 93 / 479819 4 / 21833 2 / 51729
uterus 1 / 38063 13 / 133582 475 / 10193077 -- 1 / 38063 13 / 133582 475 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 332 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 332 / 13135050 --
white blood cells -- -- 30 / 846268 -- -- -- 30 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --