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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.517419Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 204 / 3316537 166 / 2498449 1048 / 114162531 1463 / 109592465 204 / 3316537 166 / 2498449 1048 / 114162531 1463 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 3 / 57865 --   3 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     1 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 1 / 5047110 0 / 4978364
brain 48 / 506301 26 / 200215 38 / 729526 233 / 4997811 48 / 506301 26 / 200215 38 / 729526 233 / 4997811
cartilage 2 / 15965 1 / 37226 -- 10 / 778035 2 / 15965 1 / 37226 -- 10 / 778035
cerebellum 6 / 90353   6 / 90885 82 / 1495938 6 / 90353 0 / 0 6 / 90885 82 / 1495938
cerebrum 15 / 198932   -- -- 15 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 2 / 3888   -- -- 2 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   9 / 151167   8 / 643586 0 / 26551 9 / 151167 0 / 98089 8 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 15 / 246043   -- -- 15 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 6 / 128826 2 / 46440 4 / 85898 398 / 12434232 6 / 128826 2 / 46440 4 / 85898 398 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721   -- 1 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 5 / 76442   2 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 12 / 106627 9 / 89898 1 / 155372 5 / 100281 12 / 106627 9 / 89898 1 / 155372 5 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 2 / 107249 1 / 66308 4 / 214987 3 / 96846 2 / 107249 1 / 66308 4 / 214987
lung 8 / 128150 21 / 170663 4 / 159917 5 / 159059 8 / 128150 21 / 170663 4 / 159917 5 / 159059
lymph node 7 / 62650   86 / 5278419 20 / 4863489 7 / 62650 0 / 27007 86 / 5278419 20 / 4863489
lymphoreticular   3 / 44303 -- -- 0 / 17836 3 / 44303 -- --
mammary gland   3 / 104307 41 / 43166038 274 / 30312656 0 / 46553 3 / 104307 41 / 43166038 274 / 30312656
muscle 4 / 74039   1 / 107836 1 / 61270 4 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 11 / 89988 2 / 94887 1 / 179472 1 / 11462 11 / 89988 2 / 94887 1 / 179472
pancreas   1 / 74930 1 / 85728   0 / 7237 1 / 74930 1 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524   -- -- 6 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland   1 / 1358 -- -- 0 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 22 / 241088   11 / 207348 -- 22 / 241088 0 / 39531 11 / 207348 --
pooled tissue 5 / 276455   -- -- 5 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 16 / 107080 5 / 266949 16 / 491794 3 / 79993 16 / 107080 5 / 266949 16 / 491794
retina 2 / 29438 -- 29 / 820326 5 / 88490 2 / 29438 -- 29 / 820326 5 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin 2 / 73633 1 / 125377 321 / 26905847 307 / 34522313 2 / 73633 1 / 125377 321 / 26905847 307 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 22 / 6230144 -- -- -- 22 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 1 / 65644 4 / 124767 3 / 448716 1 / 26641 1 / 65644 4 / 124767 3 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 12 / 100058 -- 87 / 12372003 2 / 143630 12 / 100058 -- 87 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 4 / 11737 1 / 32606 5 / 115938 2 / 124664 4 / 11737 1 / 32606 5 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 7 / 207932 36 / 479819   2 / 51729 7 / 207932 36 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus 3 / 38063   295 / 10193077 -- 3 / 38063 0 / 133582 295 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 157 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 157 / 13135050 --
white blood cells -- -- 11 / 846268 -- -- -- 11 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --