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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.516866Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 245 / 3316537 75 / 2498449 2164 / 114162531 3399 / 109592465 245 / 3316537 75 / 2498449 2164 / 114162531 3399 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   1 / 29891 80 / 5047110 39 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 80 / 5047110 39 / 4978364
brain 53 / 506301 16 / 200215 26 / 729526 136 / 4997811 53 / 506301 16 / 200215 26 / 729526 136 / 4997811
cartilage 1 / 15965 1 / 37226 -- 3 / 778035 1 / 15965 1 / 37226 -- 3 / 778035
cerebellum 13 / 90353   3 / 90885 42 / 1495938 13 / 90353 0 / 0 3 / 90885 42 / 1495938
cerebrum 17 / 198932   -- -- 17 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   2 / 151167   1 / 643586 0 / 26551 2 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 14 / 246043   -- -- 14 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564 1 / 2857 -- -- 4 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 23 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 627 / 12434232 23 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 627 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803 1 / 12721   -- 2 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 3 / 76442     -- 3 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney   6 / 89898 1 / 155372 2 / 100281 0 / 106627 6 / 89898 1 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 7 / 96846   2 / 66308   7 / 96846 0 / 107249 2 / 66308 0 / 214987
lung 5 / 128150 6 / 170663 2 / 159917   5 / 128150 6 / 170663 2 / 159917 0 / 159059
lymph node 3 / 62650   112 / 5278419 18 / 4863489 3 / 62650 0 / 27007 112 / 5278419 18 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 5 / 46553 1 / 104307 55 / 43166038 393 / 30312656 5 / 46553 1 / 104307 55 / 43166038 393 / 30312656
muscle 2 / 74039 1 / 27691     2 / 74039 1 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   1 / 89988 1 / 94887 2 / 179472 0 / 11462 1 / 89988 1 / 94887 2 / 179472
pancreas 4 / 7237 1 / 74930   3 / 189999 4 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 7 / 96524   -- -- 7 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   5 / 20557 -- -- 0 / 24 5 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 20 / 241088   8 / 207348 -- 20 / 241088 0 / 39531 8 / 207348 --
pooled tissue 20 / 276455   -- -- 20 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993   3 / 266949 1 / 491794 2 / 79993 0 / 107080 3 / 266949 1 / 491794
retina 17 / 29438 -- 80 / 820326 8 / 88490 17 / 29438 -- 80 / 820326 8 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 5 / 73633 11 / 125377 644 / 26905847 1735 / 34522313 5 / 73633 11 / 125377 644 / 26905847 1735 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 106 / 6230144 -- -- -- 106 / 6230144 --
stomach 2 / 26641   1 / 124767 8 / 448716 2 / 26641 0 / 65644 1 / 124767 8 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 1 / 100058 -- 372 / 12372003 1 / 143630 1 / 100058 -- 372 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   4 / 32606 2 / 115938 5 / 124664 0 / 11737 4 / 32606 2 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 9 / 479819   4 / 51729 2 / 207932 9 / 479819 0 / 21833 4 / 51729
uterus 5 / 38063 2 / 133582 691 / 10193077 -- 5 / 38063 2 / 133582 691 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 341 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 341 / 13135050 --
white blood cells -- -- 5 / 846268 -- -- -- 5 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --