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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.516837Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 179 / 3316537 222 / 2498449 2686 / 114162531 2274 / 109592465 179 / 3316537 222 / 2498449 2686 / 114162531 2274 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 -- 6 / 83577 0 / 16077 3 / 57865 -- 6 / 83577
bone marrow 4 / 14774   5 / 5047110 41 / 4978364 4 / 14774 0 / 29891 5 / 5047110 41 / 4978364
brain 22 / 506301 16 / 200215 38 / 729526 135 / 4997811 22 / 506301 16 / 200215 38 / 729526 135 / 4997811
cartilage 1 / 15965 1 / 37226 -- 40 / 778035 1 / 15965 1 / 37226 -- 40 / 778035
cerebellum 5 / 90353   1 / 90885 20 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 1 / 90885 20 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   4 / 44577 -- -- 0 / 3888 4 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 11 / 151167 3 / 98089 27 / 643586 1 / 26551 11 / 151167 3 / 98089 27 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 32 / 246043   -- -- 32 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 10 / 128826 5 / 46440 1 / 85898 469 / 12434232 10 / 128826 5 / 46440 1 / 85898 469 / 12434232
gastrointestinal tract   5 / 12721 1 / 45908 -- 0 / 28803 5 / 12721 1 / 45908 --
heart 1 / 76442   3 / 83063 -- 1 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 11 / 106627 7 / 89898 6 / 155372 6 / 100281 11 / 106627 7 / 89898 6 / 155372 6 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 4 / 96846 12 / 107249 1 / 66308   4 / 96846 12 / 107249 1 / 66308 0 / 214987
lung 6 / 128150 36 / 170663 2 / 159917 8 / 159059 6 / 128150 36 / 170663 2 / 159917 8 / 159059
lymph node 5 / 62650 2 / 27007 36 / 5278419 4 / 4863489 5 / 62650 2 / 27007 36 / 5278419 4 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 7 / 44303 -- -- 1 / 17836 7 / 44303 -- --
mammary gland   8 / 104307 1746 / 43166038 463 / 30312656 0 / 46553 8 / 104307 1746 / 43166038 463 / 30312656
muscle   5 / 27691 6 / 107836   0 / 74039 5 / 27691 6 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   10 / 89988 2 / 94887 10 / 179472 0 / 11462 10 / 89988 2 / 94887 10 / 179472
pancreas   11 / 74930 4 / 85728 11 / 189999 0 / 7237 11 / 74930 4 / 85728 11 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 12 / 241088 4 / 39531 4 / 207348 -- 12 / 241088 4 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 5 / 276455   -- -- 5 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 13 / 79993 14 / 107080 2 / 266949 16 / 491794 13 / 79993 14 / 107080 2 / 266949 16 / 491794
retina 4 / 29438 -- 11 / 820326 1 / 88490 4 / 29438 -- 11 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 8 / 73633 8 / 125377 348 / 26905847 587 / 34522313 8 / 73633 8 / 125377 348 / 26905847 587 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 108 / 6230144 -- -- -- 108 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 3 / 65644   10 / 448716 1 / 26641 3 / 65644 0 / 124767 10 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 8 / 143630 3 / 100058 -- 420 / 12372003 8 / 143630 3 / 100058 -- 420 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 4 / 32606 1 / 115938   1 / 11737 4 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 7 / 207932 31 / 479819     7 / 207932 31 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 4 / 38063 12 / 133582 164 / 10193077 -- 4 / 38063 12 / 133582 164 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 175 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 175 / 13135050 --
white blood cells -- -- 18 / 846268 -- -- -- 18 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --