Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.516646Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 234 / 3316537 113 / 2498449 18450 / 114162531 33143 / 109592465 234 / 3316537 113 / 2498449 18450 / 114162531 33143 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 1 / 57865 --   3 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   7 / 29891 127 / 5047110 77 / 4978364 0 / 14774 7 / 29891 127 / 5047110 77 / 4978364
brain 34 / 506301 3 / 200215 100 / 729526 579 / 4997811 34 / 506301 3 / 200215 100 / 729526 579 / 4997811
cartilage 1 / 15965 7 / 37226 -- 17 / 778035 1 / 15965 7 / 37226 -- 17 / 778035
cerebellum 5 / 90353   14 / 90885 160 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 14 / 90885 160 / 1495938
cerebrum 7 / 198932   -- -- 7 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 4 / 151167   217 / 643586 2 / 26551 4 / 151167 0 / 98089 217 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 18 / 246043   -- -- 18 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 11 / 128826 4 / 46440 1 / 85898 4460 / 12434232 11 / 128826 4 / 46440 1 / 85898 4460 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803   3 / 45908 -- 2 / 28803 0 / 12721 3 / 45908 --
heart 6 / 76442   13 / 83063 -- 6 / 76442 0 / 1 13 / 83063 --
kidney 6 / 106627 4 / 89898 17 / 155372 99 / 100281 6 / 106627 4 / 89898 17 / 155372 99 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 10 / 107249 5 / 66308 120 / 214987 3 / 96846 10 / 107249 5 / 66308 120 / 214987
lung 6 / 128150 3 / 170663 16 / 159917 12 / 159059 6 / 128150 3 / 170663 16 / 159917 12 / 159059
lymph node 18 / 62650 3 / 27007 629 / 5278419 221 / 4863489 18 / 62650 3 / 27007 629 / 5278419 221 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 6 / 44303 -- -- 1 / 17836 6 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 6 / 104307 104 / 43166038 14292 / 30312656 2 / 46553 6 / 104307 104 / 43166038 14292 / 30312656
muscle 2 / 74039   13 / 107836 4 / 61270 2 / 74039 0 / 27691 13 / 107836 4 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 36 / 94887 19 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 36 / 94887 19 / 179472
pancreas   3 / 74930   12 / 189999 0 / 7237 3 / 74930 0 / 85728 12 / 189999
pancreatic islet 9 / 96524   -- -- 9 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 14 / 241088 1 / 39531 12 / 207348 -- 14 / 241088 1 / 39531 12 / 207348 --
pooled tissue 21 / 276455   -- -- 21 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 2 / 107080 37 / 266949 45 / 491794 6 / 79993 2 / 107080 37 / 266949 45 / 491794
retina 4 / 29438 -- 324 / 820326 7 / 88490 4 / 29438 -- 324 / 820326 7 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 3 / 73633 4 / 125377 8666 / 26905847 11062 / 34522313 3 / 73633 4 / 125377 8666 / 26905847 11062 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 973 / 6230144 -- -- -- 973 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 4 / 65644 7 / 124767 53 / 448716 1 / 26641 4 / 65644 7 / 124767 53 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 19 / 143630 7 / 100058 -- 1632 / 12372003 19 / 143630 7 / 100058 -- 1632 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 10 / 115938 30 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 10 / 115938 30 / 124664
uncharacterized tissue 19 / 207932 22 / 479819 2 / 21833 25 / 51729 19 / 207932 22 / 479819 2 / 21833 25 / 51729
uterus 3 / 38063 5 / 133582 471 / 10193077 -- 3 / 38063 5 / 133582 471 / 10193077 --
vascular 5 / 46250 -- 6813 / 13135050 -- 5 / 46250 -- 6813 / 13135050 --
white blood cells -- -- 57 / 846268 -- -- -- 57 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --