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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.515515Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 478 / 3316537 474 / 2498449 17497 / 114162531 20608 / 109592465 478 / 3316537 474 / 2498449 17497 / 114162531 20608 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 12 / 57865 --   3 / 16077 12 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774   26 / 5047110 33 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 26 / 5047110 33 / 4978364
brain 33 / 506301 45 / 200215 49 / 729526 785 / 4997811 33 / 506301 45 / 200215 49 / 729526 785 / 4997811
cartilage   8 / 37226 -- 45 / 778035 0 / 15965 8 / 37226 -- 45 / 778035
cerebellum 7 / 90353   5 / 90885 252 / 1495938 7 / 90353 0 / 0 5 / 90885 252 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   15 / 44577 -- -- 0 / 3888 15 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 27 / 151167 12 / 98089 135 / 643586 2 / 26551 27 / 151167 12 / 98089 135 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 81 / 246043   -- -- 81 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564   -- -- 4 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   5 / 17290 -- -- 0 / 270 5 / 17290 -- --
eye 23 / 128826 16 / 46440 10 / 85898 2775 / 12434232 23 / 128826 16 / 46440 10 / 85898 2775 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803 12 / 12721 3 / 45908 -- 2 / 28803 12 / 12721 3 / 45908 --
heart 16 / 76442   5 / 83063 -- 16 / 76442 0 / 1 5 / 83063 --
kidney 1 / 106627 10 / 89898 31 / 155372 14 / 100281 1 / 106627 10 / 89898 31 / 155372 14 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 7 / 96846 22 / 107249 9 / 66308 33 / 214987 7 / 96846 22 / 107249 9 / 66308 33 / 214987
lung 18 / 128150 27 / 170663 29 / 159917 24 / 159059 18 / 128150 27 / 170663 29 / 159917 24 / 159059
lymph node 3 / 62650   368 / 5278419 111 / 4863489 3 / 62650 0 / 27007 368 / 5278419 111 / 4863489
lymphoreticular 3 / 17836 3 / 44303 -- -- 3 / 17836 3 / 44303 -- --
mammary gland 14 / 46553 9 / 104307 3000 / 43166038 6515 / 30312656 14 / 46553 9 / 104307 3000 / 43166038 6515 / 30312656
muscle 5 / 74039 5 / 27691 4 / 107836 9 / 61270 5 / 74039 5 / 27691 4 / 107836 9 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 27 / 89988 8 / 94887 37 / 179472 3 / 11462 27 / 89988 8 / 94887 37 / 179472
pancreas   18 / 74930 4 / 85728 28 / 189999 0 / 7237 18 / 74930 4 / 85728 28 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524 2 / 30072 -- -- 5 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 4 / 13260 2 / 1358 -- -- 4 / 13260 2 / 1358 -- --
placenta 99 / 241088 16 / 39531 67 / 207348 -- 99 / 241088 16 / 39531 67 / 207348 --
pooled tissue 40 / 276455   -- -- 40 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 24 / 107080 40 / 266949 52 / 491794 5 / 79993 24 / 107080 40 / 266949 52 / 491794
retina 4 / 29438 -- 71 / 820326 30 / 88490 4 / 29438 -- 71 / 820326 30 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 18 / 73633 15 / 125377 4939 / 26905847 7751 / 34522313 18 / 73633 15 / 125377 4939 / 26905847 7751 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 7 / 52939   -- -- 7 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1266 / 6230144 -- -- -- 1266 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 29 / 65644 24 / 124767 121 / 448716 2 / 26641 29 / 65644 24 / 124767 121 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 18 / 143630 12 / 100058 -- 1828 / 12372003 18 / 143630 12 / 100058 -- 1828 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 8 / 32606 25 / 115938 21 / 124664 2 / 11737 8 / 32606 25 / 115938 21 / 124664
uncharacterized tissue 21 / 207932 79 / 479819   9 / 51729 21 / 207932 79 / 479819 0 / 21833 9 / 51729
uterus 7 / 38063 19 / 133582 1713 / 10193077 -- 7 / 38063 19 / 133582 1713 / 10193077 --
vascular 8 / 46250 -- 5747 / 13135050 -- 8 / 46250 -- 5747 / 13135050 --
white blood cells -- -- 42 / 846268 -- -- -- 42 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --