Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.515018Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 233 / 3316537 145 / 2498449 3915 / 114162531 6587 / 109592465 233 / 3316537 145 / 2498449 3915 / 114162531 6587 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 2 / 57865 --   2 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 3 / 14774 1 / 29891 15 / 5047110 68 / 4978364 3 / 14774 1 / 29891 15 / 5047110 68 / 4978364
brain 54 / 506301 9 / 200215 19 / 729526 430 / 4997811 54 / 506301 9 / 200215 19 / 729526 430 / 4997811
cartilage   3 / 37226 -- 11 / 778035 0 / 15965 3 / 37226 -- 11 / 778035
cerebellum 6 / 90353   6 / 90885 145 / 1495938 6 / 90353 0 / 0 6 / 90885 145 / 1495938
cerebrum 16 / 198932   -- -- 16 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon   9 / 151167 8 / 98089 8 / 643586 0 / 26551 9 / 151167 8 / 98089 8 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 23 / 246043   -- -- 23 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 3 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 536 / 12434232 3 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 536 / 12434232
gastrointestinal tract     1 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 6 / 106627 4 / 89898 3 / 155372   6 / 106627 4 / 89898 3 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 7 / 107249 1 / 66308 11 / 214987 3 / 96846 7 / 107249 1 / 66308 11 / 214987
lung 6 / 128150 8 / 170663 13 / 159917 6 / 159059 6 / 128150 8 / 170663 13 / 159917 6 / 159059
lymph node 19 / 62650 4 / 27007 1413 / 5278419 105 / 4863489 19 / 62650 4 / 27007 1413 / 5278419 105 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 3 / 104307 642 / 43166038 2419 / 30312656 1 / 46553 3 / 104307 642 / 43166038 2419 / 30312656
muscle 8 / 74039 1 / 27691 1 / 107836 1 / 61270 8 / 74039 1 / 27691 1 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 3 / 89988 2 / 94887 6 / 179472 1 / 11462 3 / 89988 2 / 94887 6 / 179472
pancreas   1 / 74930 2 / 85728 6 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 2 / 85728 6 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 23 / 241088 2 / 39531 18 / 207348 -- 23 / 241088 2 / 39531 18 / 207348 --
pooled tissue 10 / 276455   -- -- 10 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 6 / 107080 4 / 266949 10 / 491794 2 / 79993 6 / 107080 4 / 266949 10 / 491794
retina   -- 15 / 820326 6 / 88490 0 / 29438 -- 15 / 820326 6 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 15 / 125377 509 / 26905847 2421 / 34522313 4 / 73633 15 / 125377 509 / 26905847 2421 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 176 / 6230144 -- -- -- 176 / 6230144 --
stomach   6 / 65644 7 / 124767 28 / 448716 0 / 26641 6 / 65644 7 / 124767 28 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 13 / 143630 2 / 100058 -- 353 / 12372003 13 / 143630 2 / 100058 -- 353 / 12372003
thymus 2 / 4478   -- -- 2 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 6 / 115938 12 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 6 / 115938 12 / 124664
uncharacterized tissue 11 / 207932 34 / 479819   5 / 51729 11 / 207932 34 / 479819 0 / 21833 5 / 51729
uterus   17 / 133582 699 / 10193077 -- 0 / 38063 17 / 133582 699 / 10193077 --
vascular 5 / 46250 -- 311 / 13135050 -- 5 / 46250 -- 311 / 13135050 --
white blood cells -- -- 42 / 846268 -- -- -- 42 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --