Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.514423Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 49 / 3316537 56 / 2498449 1087 / 114162531 752 / 109592465 49 / 3316537 56 / 2498449 1087 / 114162531 752 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     5 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 5 / 5047110 0 / 4978364
brain 34 / 506301 30 / 200215 52 / 729526 74 / 4997811 34 / 506301 30 / 200215 52 / 729526 74 / 4997811
cartilage     -- 2 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum     1 / 90885 7 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 7 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   1 / 151167   5 / 643586 0 / 26551 1 / 151167 0 / 98089 5 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 2 / 246043   -- -- 2 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 4 / 128826   1 / 85898 316 / 12434232 4 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 316 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442     -- 1 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney   1 / 89898   3 / 100281 0 / 106627 1 / 89898 0 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver       2 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung   1 / 170663     0 / 128150 1 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node     8 / 5278419 6 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 8 / 5278419 6 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 6 / 104307 814 / 43166038 197 / 30312656 2 / 46553 6 / 104307 814 / 43166038 197 / 30312656
muscle 1 / 74039     2 / 61270 1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 2 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   3 / 89988   3 / 179472 0 / 11462 3 / 89988 0 / 94887 3 / 179472
pancreas   2 / 74930     0 / 7237 2 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524   -- -- 1 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta       -- 0 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue     -- -- 0 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 1 / 107080   2 / 491794 1 / 79993 1 / 107080 0 / 266949 2 / 491794
retina   -- 2 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 2 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     125 / 26905847 76 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 125 / 26905847 76 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 20 / 6230144 -- -- -- 20 / 6230144 --
stomach   1 / 65644   1 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 55 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 55 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737   2 / 115938   1 / 11737 0 / 32606 2 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue   6 / 479819 1 / 21833   0 / 207932 6 / 479819 1 / 21833 0 / 51729
uterus   3 / 133582 36 / 10193077 -- 0 / 38063 3 / 133582 36 / 10193077 --
vascular   -- 19 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 19 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1 / 846268 -- -- -- 1 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --