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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.513520Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 291 / 3316537 255 / 2498449 10123 / 114162531 2342 / 109592465 291 / 3316537 255 / 2498449 10123 / 114162531 2342 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 4 / 57865 -- 19 / 83577 3 / 16077 4 / 57865 -- 19 / 83577
bone marrow   2 / 29891 26 / 5047110 24 / 4978364 0 / 14774 2 / 29891 26 / 5047110 24 / 4978364
brain 33 / 506301 29 / 200215 21 / 729526 130 / 4997811 33 / 506301 29 / 200215 21 / 729526 130 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 35 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 35 / 778035
cerebellum 6 / 90353     34 / 1495938 6 / 90353 0 / 0 0 / 90885 34 / 1495938
cerebrum 9 / 198932   -- -- 9 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 2 / 3888 6 / 44577 -- -- 2 / 3888 6 / 44577 -- --
colon   12 / 151167 2 / 98089 38 / 643586 0 / 26551 12 / 151167 2 / 98089 38 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 17 / 246043   -- -- 17 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 5 / 19564   -- -- 5 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 20 / 128826 3 / 46440 4 / 85898 166 / 12434232 20 / 128826 3 / 46440 4 / 85898 166 / 12434232
gastrointestinal tract 6 / 28803 4 / 12721   -- 6 / 28803 4 / 12721 0 / 45908 --
heart 10 / 76442     -- 10 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 1 / 106627 13 / 89898 8 / 155372 1 / 100281 1 / 106627 13 / 89898 8 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 9 / 96846 13 / 107249   4 / 214987 9 / 96846 13 / 107249 0 / 66308 4 / 214987
lung 11 / 128150 12 / 170663 1 / 159917 6 / 159059 11 / 128150 12 / 170663 1 / 159917 6 / 159059
lymph node 8 / 62650 1 / 27007 58 / 5278419 4 / 4863489 8 / 62650 1 / 27007 58 / 5278419 4 / 4863489
lymphoreticular   3 / 44303 -- -- 0 / 17836 3 / 44303 -- --
mammary gland 7 / 46553 3 / 104307 8395 / 43166038 758 / 30312656 7 / 46553 3 / 104307 8395 / 43166038 758 / 30312656
muscle 5 / 74039 2 / 27691 5 / 107836   5 / 74039 2 / 27691 5 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 7 / 89988 7 / 94887 8 / 179472 3 / 11462 7 / 89988 7 / 94887 8 / 179472
pancreas   16 / 74930 7 / 85728 14 / 189999 0 / 7237 16 / 74930 7 / 85728 14 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524 3 / 30072 -- -- 1 / 96524 3 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 28 / 241088 4 / 39531 2 / 207348 -- 28 / 241088 4 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 22 / 276455   -- -- 22 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 8 / 107080 14 / 266949 23 / 491794 5 / 79993 8 / 107080 14 / 266949 23 / 491794
retina   -- 7 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 7 / 820326 1 / 88490
salivary gland 2 / 2490 4 / 10368 -- -- 2 / 2490 4 / 10368 -- --
skin 2 / 73633 22 / 125377 650 / 26905847 785 / 34522313 2 / 73633 22 / 125377 650 / 26905847 785 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 189 / 6230144 -- -- -- 189 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 1 / 65644   8 / 448716 3 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 8 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 44 / 143630 4 / 100058 -- 277 / 12372003 44 / 143630 4 / 100058 -- 277 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   9 / 32606   2 / 124664 0 / 11737 9 / 32606 0 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 20 / 207932 46 / 479819 2 / 21833 5 / 51729 20 / 207932 46 / 479819 2 / 21833 5 / 51729
uterus 2 / 38063 18 / 133582 228 / 10193077 -- 2 / 38063 18 / 133582 228 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 443 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 443 / 13135050 --
white blood cells -- -- 54 / 846268 -- -- -- 54 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --