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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.513439Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 322 / 3316537 65 / 2498449 1569 / 114162531 1658 / 109592465 322 / 3316537 65 / 2498449 1569 / 114162531 1658 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077   --   1 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   1 / 29891 13 / 5047110 14 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 13 / 5047110 14 / 4978364
brain 118 / 506301 7 / 200215 22 / 729526 130 / 4997811 118 / 506301 7 / 200215 22 / 729526 130 / 4997811
cartilage 1 / 15965 1 / 37226 -- 5 / 778035 1 / 15965 1 / 37226 -- 5 / 778035
cerebellum 26 / 90353   1 / 90885 25 / 1495938 26 / 90353 0 / 0 1 / 90885 25 / 1495938
cerebrum 75 / 198932   -- -- 75 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   2 / 151167   3 / 643586 0 / 26551 2 / 151167 0 / 98089 3 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 8 / 246043   -- -- 8 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 9 / 19564 1 / 2857 -- -- 9 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 1 / 128826 1 / 46440 7 / 85898 393 / 12434232 1 / 128826 1 / 46440 7 / 85898 393 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803     -- 2 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442   1 / 83063 -- 1 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 5 / 106627 7 / 89898 3 / 155372   5 / 106627 7 / 89898 3 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 2 / 107249   1 / 214987 5 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 4 / 128150 3 / 170663 6 / 159917 5 / 159059 4 / 128150 3 / 170663 6 / 159917 5 / 159059
lymph node   1 / 27007 125 / 5278419 8 / 4863489 0 / 62650 1 / 27007 125 / 5278419 8 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   2 / 104307 197 / 43166038 361 / 30312656 0 / 46553 2 / 104307 197 / 43166038 361 / 30312656
muscle 3 / 74039   2 / 107836   3 / 74039 0 / 27691 2 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   1 / 89988 1 / 94887 1 / 179472 0 / 11462 1 / 89988 1 / 94887 1 / 179472
pancreas       1 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524   -- -- 5 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 6 / 13260   -- -- 6 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 16 / 241088   6 / 207348 -- 16 / 241088 0 / 39531 6 / 207348 --
pooled tissue 11 / 276455   -- -- 11 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 1 / 107080 1 / 266949 2 / 491794 1 / 79993 1 / 107080 1 / 266949 2 / 491794
retina   -- 24 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 24 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   2 / 125377 594 / 26905847 631 / 34522313 0 / 73633 2 / 125377 594 / 26905847 631 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 66 / 6230144 -- -- -- 66 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 6 / 65644 3 / 124767 12 / 448716 1 / 26641 6 / 65644 3 / 124767 12 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 13 / 143630 14 / 100058 -- 62 / 12372003 13 / 143630 14 / 100058 -- 62 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 3 / 115938 3 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 3 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue 7 / 207932 9 / 479819     7 / 207932 9 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 1 / 38063 1 / 133582 249 / 10193077 -- 1 / 38063 1 / 133582 249 / 10193077 --
vascular   -- 208 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 208 / 13135050 --
white blood cells -- -- 37 / 846268 -- -- -- 37 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --