Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.513039Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 139 / 3316537 192 / 2498449 4048 / 114162531 1640 / 109592465 139 / 3316537 192 / 2498449 4048 / 114162531 1640 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 -- 2 / 83577 0 / 16077 1 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow 1 / 14774 6 / 29891 212 / 5047110 191 / 4978364 1 / 14774 6 / 29891 212 / 5047110 191 / 4978364
brain 24 / 506301 10 / 200215 11 / 729526 64 / 4997811 24 / 506301 10 / 200215 11 / 729526 64 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 5 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 5 / 778035
cerebellum 5 / 90353   1 / 90885 12 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 1 / 90885 12 / 1495938
cerebrum 8 / 198932   -- -- 8 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon   15 / 151167 1 / 98089 10 / 643586 0 / 26551 15 / 151167 1 / 98089 10 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 20 / 246043   -- -- 20 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 7 / 128826 9 / 46440   675 / 12434232 7 / 128826 9 / 46440 0 / 85898 675 / 12434232
gastrointestinal tract   1 / 12721   -- 0 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442     -- 2 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 3 / 106627 8 / 89898 2 / 155372 5 / 100281 3 / 106627 8 / 89898 2 / 155372 5 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 6 / 107249 1 / 66308   1 / 96846 6 / 107249 1 / 66308 0 / 214987
lung 4 / 128150 10 / 170663     4 / 128150 10 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node 8 / 62650 1 / 27007 15 / 5278419 1 / 4863489 8 / 62650 1 / 27007 15 / 5278419 1 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 3 / 44303 -- -- 1 / 17836 3 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 18 / 104307 3041 / 43166038 240 / 30312656 1 / 46553 18 / 104307 3041 / 43166038 240 / 30312656
muscle 3 / 74039 4 / 27691     3 / 74039 4 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 7 / 89988 2 / 94887 2 / 179472 1 / 11462 7 / 89988 2 / 94887 2 / 179472
pancreas   7 / 74930 2 / 85728 5 / 189999 0 / 7237 7 / 74930 2 / 85728 5 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524 1 / 30072 -- -- 1 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 12 / 241088 4 / 39531 1 / 207348 -- 12 / 241088 4 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 11 / 276455   -- -- 11 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 1 / 107080 2 / 266949 4 / 491794 2 / 79993 1 / 107080 2 / 266949 4 / 491794
retina 1 / 29438 -- 8 / 820326 2 / 88490 1 / 29438 -- 8 / 820326 2 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 12 / 125377 196 / 26905847 219 / 34522313 1 / 73633 12 / 125377 196 / 26905847 219 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 175 / 6230144 -- -- -- 175 / 6230144 --
stomach       4 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 4 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 15 / 100058 -- 197 / 12372003 3 / 143630 15 / 100058 -- 197 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 2 / 32606   2 / 124664 1 / 11737 2 / 32606 0 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 10 / 207932 32 / 479819 1 / 21833   10 / 207932 32 / 479819 1 / 21833 0 / 51729
uterus 1 / 38063 11 / 133582 139 / 10193077 -- 1 / 38063 11 / 133582 139 / 10193077 --
vascular   -- 230 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 230 / 13135050 --
white blood cells -- -- 8 / 846268 -- -- -- 8 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --