Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.509067Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 204 / 3316537 135 / 2498449 6460 / 114162531 1923 / 109592465 204 / 3316537 135 / 2498449 6460 / 114162531 1923 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 7 / 16077 5 / 57865 -- 7 / 83577 7 / 16077 5 / 57865 -- 7 / 83577
bone marrow 1 / 14774   1 / 5047110   1 / 14774 0 / 29891 1 / 5047110 0 / 4978364
brain 23 / 506301 12 / 200215 12 / 729526 54 / 4997811 23 / 506301 12 / 200215 12 / 729526 54 / 4997811
cartilage   6 / 37226 -- 30 / 778035 0 / 15965 6 / 37226 -- 30 / 778035
cerebellum       2 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 2 / 1495938
cerebrum 7 / 198932   -- -- 7 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 18 / 151167   3 / 643586 1 / 26551 18 / 151167 0 / 98089 3 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 22 / 246043   -- -- 22 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 20 / 128826   2 / 85898 94 / 12434232 20 / 128826 0 / 46440 2 / 85898 94 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 6 / 76442   1 / 83063 -- 6 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 5 / 106627 9 / 89898 1 / 155372   5 / 106627 9 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   1 / 107249   1 / 214987 0 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 13 / 128150 7 / 170663   4 / 159059 13 / 128150 7 / 170663 0 / 159917 4 / 159059
lymph node 1 / 62650   40 / 5278419   1 / 62650 0 / 27007 40 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 6 / 46553 2 / 104307 5102 / 43166038 1017 / 30312656 6 / 46553 2 / 104307 5102 / 43166038 1017 / 30312656
muscle 3 / 74039   2 / 107836 3 / 61270 3 / 74039 0 / 27691 2 / 107836 3 / 61270
nervous 4 / 10333   -- -- 4 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 6 / 11462 6 / 89988 2 / 94887 6 / 179472 6 / 11462 6 / 89988 2 / 94887 6 / 179472
pancreas 4 / 7237 8 / 74930   5 / 189999 4 / 7237 8 / 74930 0 / 85728 5 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524 1 / 30072 -- -- 3 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 5 / 14891   -- -- 5 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 11 / 241088     -- 11 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 8 / 276455   -- -- 8 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 7 / 79993 1 / 107080 3 / 266949 3 / 491794 7 / 79993 1 / 107080 3 / 266949 3 / 491794
retina   --     0 / 29438 -- 0 / 820326 0 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 13 / 73633 2 / 125377 327 / 26905847 574 / 34522313 13 / 73633 2 / 125377 327 / 26905847 574 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 20 / 6230144 -- -- -- 20 / 6230144 --
stomach   6 / 65644   7 / 448716 0 / 26641 6 / 65644 0 / 124767 7 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 8 / 143630   -- 112 / 12372003 8 / 143630 0 / 100058 -- 112 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   5 / 32606 3 / 115938 1 / 124664 0 / 11737 5 / 32606 3 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 4 / 207932 33 / 479819     4 / 207932 33 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 9 / 38063 11 / 133582 928 / 10193077 -- 9 / 38063 11 / 133582 928 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 16 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 16 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --