Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.506852Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 190 / 3316537 187 / 2498449 3566 / 114162531 5549 / 109592465 190 / 3316537 187 / 2498449 3566 / 114162531 5549 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   8 / 57865 --   0 / 16077 8 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     3 / 5047110 25 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 3 / 5047110 25 / 4978364
brain 41 / 506301 16 / 200215 28 / 729526 297 / 4997811 41 / 506301 16 / 200215 28 / 729526 297 / 4997811
cartilage 1 / 15965 6 / 37226 -- 34 / 778035 1 / 15965 6 / 37226 -- 34 / 778035
cerebellum 3 / 90353   1 / 90885 51 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 1 / 90885 51 / 1495938
cerebrum 16 / 198932   -- -- 16 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   5 / 44577 -- -- 0 / 3888 5 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 8 / 151167   13 / 643586 2 / 26551 8 / 151167 0 / 98089 13 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 31 / 246043   -- -- 31 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 2 / 128826 7 / 46440 1 / 85898 876 / 12434232 2 / 128826 7 / 46440 1 / 85898 876 / 12434232
gastrointestinal tract   1 / 12721 1 / 45908 -- 0 / 28803 1 / 12721 1 / 45908 --
heart 7 / 76442   3 / 83063 -- 7 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 6 / 106627 6 / 89898 5 / 155372 1 / 100281 6 / 106627 6 / 89898 5 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 6 / 107249 4 / 66308 3 / 214987 3 / 96846 6 / 107249 4 / 66308 3 / 214987
lung 5 / 128150 8 / 170663 1 / 159917 3 / 159059 5 / 128150 8 / 170663 1 / 159917 3 / 159059
lymph node 9 / 62650   52 / 5278419 31 / 4863489 9 / 62650 0 / 27007 52 / 5278419 31 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 6 / 104307 263 / 43166038 1479 / 30312656 1 / 46553 6 / 104307 263 / 43166038 1479 / 30312656
muscle 4 / 74039 2 / 27691 2 / 107836 3 / 61270 4 / 74039 2 / 27691 2 / 107836 3 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   7 / 89988 1 / 94887 1 / 179472 0 / 11462 7 / 89988 1 / 94887 1 / 179472
pancreas     1 / 85728 3 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524 1 / 30072 -- -- 6 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid   5 / 20557 -- -- 0 / 24 5 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 7 / 241088 3 / 39531 4 / 207348 -- 7 / 241088 3 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 21 / 276455   -- -- 21 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 9 / 107080 6 / 266949 8 / 491794 2 / 79993 9 / 107080 6 / 266949 8 / 491794
retina   -- 17 / 820326 4 / 88490 0 / 29438 -- 17 / 820326 4 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 2 / 73633 21 / 125377 1498 / 26905847 1729 / 34522313 2 / 73633 21 / 125377 1498 / 26905847 1729 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 576 / 6230144 -- -- -- 576 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 5 / 65644 2 / 124767 8 / 448716 2 / 26641 5 / 65644 2 / 124767 8 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 10 / 100058 -- 971 / 12372003 2 / 143630 10 / 100058 -- 971 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 4 / 32606 2 / 115938 9 / 124664 1 / 11737 4 / 32606 2 / 115938 9 / 124664
uncharacterized tissue 7 / 207932 20 / 479819     7 / 207932 20 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 3 / 38063 20 / 133582 258 / 10193077 -- 3 / 38063 20 / 133582 258 / 10193077 --
vascular   -- 820 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 820 / 13135050 --
white blood cells -- -- 17 / 846268 -- -- -- 17 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --