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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.506374Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 143 / 3316537 80 / 2498449 7934 / 114162531 10482 / 109592465 143 / 3316537 80 / 2498449 7934 / 114162531 10482 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 --   0 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 4 / 14774   136 / 5047110 63 / 4978364 4 / 14774 0 / 29891 136 / 5047110 63 / 4978364
brain   4 / 200215 33 / 729526 480 / 4997811 0 / 506301 4 / 200215 33 / 729526 480 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 31 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 31 / 778035
cerebellum     5 / 90885 147 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 5 / 90885 147 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 3 / 151167 2 / 98089 29 / 643586 1 / 26551 3 / 151167 2 / 98089 29 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 18 / 246043   -- -- 18 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 9 / 19564   -- -- 9 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 4 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 644 / 12434232 4 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 644 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 5 / 76442   39 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 39 / 83063 --
kidney 4 / 106627 4 / 89898 16 / 155372 3 / 100281 4 / 106627 4 / 89898 16 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 11 / 96846 7 / 107249 5 / 66308 14 / 214987 11 / 96846 7 / 107249 5 / 66308 14 / 214987
lung 2 / 128150 13 / 170663 12 / 159917 7 / 159059 2 / 128150 13 / 170663 12 / 159917 7 / 159059
lymph node 2 / 62650   540 / 5278419 1376 / 4863489 2 / 62650 0 / 27007 540 / 5278419 1376 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 11 / 104307 238 / 43166038 3012 / 30312656 1 / 46553 11 / 104307 238 / 43166038 3012 / 30312656
muscle 8 / 74039 3 / 27691 15 / 107836 1 / 61270 8 / 74039 3 / 27691 15 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 12 / 94887 9 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 12 / 94887 9 / 179472
pancreas     3 / 85728 14 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 3 / 85728 14 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524   -- -- 5 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system   1 / 645 -- -- 0 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 4 / 241088   27 / 207348 -- 4 / 241088 0 / 39531 27 / 207348 --
pooled tissue 30 / 276455   -- -- 30 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993 3 / 107080 55 / 266949 33 / 491794 4 / 79993 3 / 107080 55 / 266949 33 / 491794
retina   -- 107 / 820326 8 / 88490 0 / 29438 -- 107 / 820326 8 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     2855 / 26905847 3128 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 2855 / 26905847 3128 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 955 / 6230144 -- -- -- 955 / 6230144 --
stomach     10 / 124767 87 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 10 / 124767 87 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 2 / 100058 -- 1337 / 12372003 2 / 143630 2 / 100058 -- 1337 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 28 / 115938 44 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 28 / 115938 44 / 124664
uncharacterized tissue 20 / 207932 15 / 479819   15 / 51729 20 / 207932 15 / 479819 0 / 21833 15 / 51729
uterus   2 / 133582 417 / 10193077 -- 0 / 38063 2 / 133582 417 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 2393 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 2393 / 13135050 --
white blood cells -- -- 30 / 846268 -- -- -- 30 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --