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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.505824Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 304 / 3316537 310 / 2498449 5491 / 114162531 3661 / 109592465 304 / 3316537 310 / 2498449 5491 / 114162531 3661 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 3 / 57865 -- 10 / 83577 2 / 16077 3 / 57865 -- 10 / 83577
bone marrow 1 / 14774 2 / 29891 99 / 5047110 48 / 4978364 1 / 14774 2 / 29891 99 / 5047110 48 / 4978364
brain 43 / 506301 30 / 200215 17 / 729526 206 / 4997811 43 / 506301 30 / 200215 17 / 729526 206 / 4997811
cartilage 1 / 15965 3 / 37226 -- 24 / 778035 1 / 15965 3 / 37226 -- 24 / 778035
cerebellum 14 / 90353   3 / 90885 54 / 1495938 14 / 90353 0 / 0 3 / 90885 54 / 1495938
cerebrum 12 / 198932   -- -- 12 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   11 / 44577 -- -- 0 / 3888 11 / 44577 -- --
colon 4 / 26551 9 / 151167 4 / 98089 26 / 643586 4 / 26551 9 / 151167 4 / 98089 26 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 20 / 246043   -- -- 20 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564   -- -- 4 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 12 / 128826 13 / 46440 2 / 85898 414 / 12434232 12 / 128826 13 / 46440 2 / 85898 414 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803 1 / 12721 5 / 45908 -- 4 / 28803 1 / 12721 5 / 45908 --
heart 4 / 76442   2 / 83063 -- 4 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 6 / 106627 6 / 89898 9 / 155372 4 / 100281 6 / 106627 6 / 89898 9 / 155372 4 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 6 / 96846 9 / 107249 3 / 66308 6 / 214987 6 / 96846 9 / 107249 3 / 66308 6 / 214987
lung 10 / 128150 16 / 170663 7 / 159917 4 / 159059 10 / 128150 16 / 170663 7 / 159917 4 / 159059
lymph node 2 / 62650 1 / 27007 165 / 5278419 56 / 4863489 2 / 62650 1 / 27007 165 / 5278419 56 / 4863489
lymphoreticular 6 / 17836 12 / 44303 -- -- 6 / 17836 12 / 44303 -- --
mammary gland   12 / 104307 3689 / 43166038 603 / 30312656 0 / 46553 12 / 104307 3689 / 43166038 603 / 30312656
muscle 10 / 74039 4 / 27691 18 / 107836 1 / 61270 10 / 74039 4 / 27691 18 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 19 / 89988 5 / 94887 6 / 179472 1 / 11462 19 / 89988 5 / 94887 6 / 179472
pancreas   5 / 74930 3 / 85728 10 / 189999 0 / 7237 5 / 74930 3 / 85728 10 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524   -- -- 6 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 33 / 241088 6 / 39531 7 / 207348 -- 33 / 241088 6 / 39531 7 / 207348 --
pooled tissue 32 / 276455   -- -- 32 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993 13 / 107080 15 / 266949 30 / 491794 4 / 79993 13 / 107080 15 / 266949 30 / 491794
retina   -- 27 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 27 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   40 / 125377 565 / 26905847 1501 / 34522313 0 / 73633 40 / 125377 565 / 26905847 1501 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 166 / 6230144 -- -- -- 166 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 3 / 65644 8 / 124767 9 / 448716 2 / 26641 3 / 65644 8 / 124767 9 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 29 / 143630 6 / 100058 -- 637 / 12372003 29 / 143630 6 / 100058 -- 637 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 7 / 115938 5 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 7 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 19 / 207932 70 / 479819   6 / 51729 19 / 207932 70 / 479819 0 / 21833 6 / 51729
uterus 3 / 38063 10 / 133582 431 / 10193077 -- 3 / 38063 10 / 133582 431 / 10193077 --
vascular 5 / 46250 -- 217 / 13135050 -- 5 / 46250 -- 217 / 13135050 --
white blood cells -- -- 17 / 846268 -- -- -- 17 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --