Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.502823Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 230 / 3316537 278 / 2498449 16461 / 114162531 11800 / 109592465 230 / 3316537 278 / 2498449 16461 / 114162531 11800 / 109592465
adrenal cortex -- 5 / 9928 -- -- -- 5 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 11 / 57865 -- 28 / 83577 3 / 16077 11 / 57865 -- 28 / 83577
bone marrow     273 / 5047110 462 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 273 / 5047110 462 / 4978364
brain 30 / 506301 16 / 200215 113 / 729526 1184 / 4997811 30 / 506301 16 / 200215 113 / 729526 1184 / 4997811
cartilage 1 / 15965   -- 226 / 778035 1 / 15965 0 / 37226 -- 226 / 778035
cerebellum 1 / 90353   16 / 90885 285 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 16 / 90885 285 / 1495938
cerebrum 4 / 198932   -- -- 4 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 6 / 44577 -- -- 1 / 3888 6 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 18 / 151167 22 / 98089 130 / 643586 3 / 26551 18 / 151167 22 / 98089 130 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 15 / 246043   -- -- 15 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564   -- -- 3 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 27 / 128826 5 / 46440 26 / 85898 877 / 12434232 27 / 128826 5 / 46440 26 / 85898 877 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 2 / 12721 7 / 45908 -- 1 / 28803 2 / 12721 7 / 45908 --
heart 5 / 76442   24 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 24 / 83063 --
kidney   9 / 89898 29 / 155372 41 / 100281 0 / 106627 9 / 89898 29 / 155372 41 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 12 / 96846 19 / 107249 10 / 66308 31 / 214987 12 / 96846 19 / 107249 10 / 66308 31 / 214987
lung 17 / 128150 25 / 170663 66 / 159917 119 / 159059 17 / 128150 25 / 170663 66 / 159917 119 / 159059
lymph node 4 / 62650 6 / 27007 1802 / 5278419 144 / 4863489 4 / 62650 6 / 27007 1802 / 5278419 144 / 4863489
lymphoreticular 5 / 17836 5 / 44303 -- -- 5 / 17836 5 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 17 / 104307 6865 / 43166038 1778 / 30312656 1 / 46553 17 / 104307 6865 / 43166038 1778 / 30312656
muscle 9 / 74039 7 / 27691 22 / 107836 4 / 61270 9 / 74039 7 / 27691 22 / 107836 4 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 9 / 89988 29 / 94887 51 / 179472 1 / 11462 9 / 89988 29 / 94887 51 / 179472
pancreas   21 / 74930 13 / 85728 80 / 189999 0 / 7237 21 / 74930 13 / 85728 80 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524 6 / 30072 -- -- 2 / 96524 6 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 13 / 241088 10 / 39531 37 / 207348 -- 13 / 241088 10 / 39531 37 / 207348 --
pooled tissue 25 / 276455   -- -- 25 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 19 / 107080 78 / 266949 126 / 491794 2 / 79993 19 / 107080 78 / 266949 126 / 491794
retina 1 / 29438 -- 116 / 820326 12 / 88490 1 / 29438 -- 116 / 820326 12 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 8 / 125377 1738 / 26905847 3487 / 34522313 4 / 73633 8 / 125377 1738 / 26905847 3487 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 971 / 6230144 -- -- -- 971 / 6230144 --
stomach 8 / 26641 4 / 65644 18 / 124767 128 / 448716 8 / 26641 4 / 65644 18 / 124767 128 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 2541 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 2541 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 4 / 32606 44 / 115938 59 / 124664 3 / 11737 4 / 32606 44 / 115938 59 / 124664
uncharacterized tissue 19 / 207932 24 / 479819 1 / 21833 7 / 51729 19 / 207932 24 / 479819 1 / 21833 7 / 51729
uterus 1 / 38063 18 / 133582 3045 / 10193077 -- 1 / 38063 18 / 133582 3045 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 1067 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 1067 / 13135050 --
white blood cells -- -- 29 / 846268 -- -- -- 29 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --