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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.501728Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 142 / 3316537 173 / 2498449 10064 / 114162531 7840 / 109592465 142 / 3316537 173 / 2498449 10064 / 114162531 7840 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 5 / 57865 -- 1 / 83577 2 / 16077 5 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow 1 / 14774 3 / 29891 137 / 5047110 169 / 4978364 1 / 14774 3 / 29891 137 / 5047110 169 / 4978364
brain 14 / 506301 3 / 200215 15 / 729526 242 / 4997811 14 / 506301 3 / 200215 15 / 729526 242 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 23 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 23 / 778035
cerebellum 1 / 90353     13 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 0 / 90885 13 / 1495938
cerebrum 2 / 198932   -- -- 2 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   5 / 44577 -- -- 0 / 3888 5 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 11 / 151167 6 / 98089 66 / 643586 3 / 26551 11 / 151167 6 / 98089 66 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 8 / 246043   -- -- 8 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 7 / 128826   1 / 85898 254 / 12434232 7 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 254 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 3 / 76442   3 / 83063 -- 3 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 2 / 106627 4 / 89898 11 / 155372 6 / 100281 2 / 106627 4 / 89898 11 / 155372 6 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 11 / 107249 1 / 66308 8 / 214987 2 / 96846 11 / 107249 1 / 66308 8 / 214987
lung 3 / 128150 6 / 170663 7 / 159917 4 / 159059 3 / 128150 6 / 170663 7 / 159917 4 / 159059
lymph node 7 / 62650 1 / 27007 700 / 5278419 40 / 4863489 7 / 62650 1 / 27007 700 / 5278419 40 / 4863489
lymphoreticular 4 / 17836 4 / 44303 -- -- 4 / 17836 4 / 44303 -- --
mammary gland 6 / 46553 2 / 104307 3042 / 43166038 2182 / 30312656 6 / 46553 2 / 104307 3042 / 43166038 2182 / 30312656
muscle 1 / 74039 2 / 27691 3 / 107836 5 / 61270 1 / 74039 2 / 27691 3 / 107836 5 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 7 / 89988 3 / 94887 7 / 179472 3 / 11462 7 / 89988 3 / 94887 7 / 179472
pancreas   7 / 74930 1 / 85728 12 / 189999 0 / 7237 7 / 74930 1 / 85728 12 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524 5 / 30072 -- -- 2 / 96524 5 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 13 / 241088 2 / 39531 10 / 207348 -- 13 / 241088 2 / 39531 10 / 207348 --
pooled tissue 15 / 276455   -- -- 15 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   18 / 107080 6 / 266949 13 / 491794 0 / 79993 18 / 107080 6 / 266949 13 / 491794
retina   -- 13 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 13 / 820326 1 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 21 / 125377 2552 / 26905847 4492 / 34522313 1 / 73633 21 / 125377 2552 / 26905847 4492 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 198 / 6230144 -- -- -- 198 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 8 / 65644 8 / 124767 33 / 448716 3 / 26641 8 / 65644 8 / 124767 33 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 4 / 100058 -- 264 / 12372003 2 / 143630 4 / 100058 -- 264 / 12372003
thymus 3 / 4478   -- -- 3 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737   8 / 115938 2 / 124664 1 / 11737 0 / 32606 8 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 22 / 207932 36 / 479819   3 / 51729 22 / 207932 36 / 479819 0 / 21833 3 / 51729
uterus 5 / 38063 4 / 133582 439 / 10193077 -- 5 / 38063 4 / 133582 439 / 10193077 --
vascular   -- 2629 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 2629 / 13135050 --
white blood cells -- -- 271 / 846268 -- -- -- 271 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --