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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.501280Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 397 / 3316537 166 / 2498449 4011 / 114162531 3546 / 109592465 397 / 3316537 166 / 2498449 4011 / 114162531 3546 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 13 / 16077 13 / 57865 -- 14 / 83577 13 / 16077 13 / 57865 -- 14 / 83577
bone marrow 2 / 14774 1 / 29891     2 / 14774 1 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 51 / 506301 20 / 200215 57 / 729526 551 / 4997811 51 / 506301 20 / 200215 57 / 729526 551 / 4997811
cartilage 1 / 15965 15 / 37226 -- 97 / 778035 1 / 15965 15 / 37226 -- 97 / 778035
cerebellum 1 / 90353   8 / 90885 43 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 8 / 90885 43 / 1495938
cerebrum 11 / 198932   -- -- 11 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   10 / 44577 -- -- 0 / 3888 10 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 8 / 151167   5 / 643586 2 / 26551 8 / 151167 0 / 98089 5 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 10 / 246043   -- -- 10 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564 3 / 2857 -- -- 1 / 19564 3 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 33 / 128826   3 / 85898 144 / 12434232 33 / 128826 0 / 46440 3 / 85898 144 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 25 / 76442     -- 25 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 6 / 106627 8 / 89898 81 / 155372 1 / 100281 6 / 106627 8 / 89898 81 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver     3 / 66308   0 / 96846 0 / 107249 3 / 66308 0 / 214987
lung 9 / 128150 4 / 170663 15 / 159917 7 / 159059 9 / 128150 4 / 170663 15 / 159917 7 / 159059
lymph node   1 / 27007 54 / 5278419 4 / 4863489 0 / 62650 1 / 27007 54 / 5278419 4 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 10 / 46553 9 / 104307 898 / 43166038 1503 / 30312656 10 / 46553 9 / 104307 898 / 43166038 1503 / 30312656
muscle       3 / 61270 0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 3 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 8 / 11462 7 / 89988 3 / 94887 16 / 179472 8 / 11462 7 / 89988 3 / 94887 16 / 179472
pancreas   9 / 74930   17 / 189999 0 / 7237 9 / 74930 0 / 85728 17 / 189999
pancreatic islet 10 / 96524   -- -- 10 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   6 / 20557 -- -- 0 / 24 6 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland 9 / 13260   -- -- 9 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 120 / 241088   5 / 207348 -- 120 / 241088 0 / 39531 5 / 207348 --
pooled tissue 14 / 276455   -- -- 14 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 3 / 107080 15 / 266949 5 / 491794 6 / 79993 3 / 107080 15 / 266949 5 / 491794
retina 3 / 29438 -- 70 / 820326   3 / 29438 -- 70 / 820326 0 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin 17 / 73633 3 / 125377 721 / 26905847 1024 / 34522313 17 / 73633 3 / 125377 721 / 26905847 1024 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 75 / 6230144 -- -- -- 75 / 6230144 --
stomach   9 / 65644   8 / 448716 0 / 26641 9 / 65644 0 / 124767 8 / 448716
synovium 1 / 249 2 / 1650 -- -- 1 / 249 2 / 1650 -- --
testis 1 / 143630   -- 102 / 12372003 1 / 143630 0 / 100058 -- 102 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 1 / 32606   2 / 124664 2 / 11737 1 / 32606 0 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 12 / 207932 23 / 479819 2 / 21833   12 / 207932 23 / 479819 2 / 21833 0 / 51729
uterus 8 / 38063 4 / 133582 1258 / 10193077 -- 8 / 38063 4 / 133582 1258 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 721 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 721 / 13135050 --
white blood cells -- -- 22 / 846268 -- -- -- 22 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --