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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.500842Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 653 / 3316537 462 / 2498449 8555 / 114162531 6488 / 109592465 653 / 3316537 462 / 2498449 8555 / 114162531 6488 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   8 / 57865 --   0 / 16077 8 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   4 / 29891 26 / 5047110 53 / 4978364 0 / 14774 4 / 29891 26 / 5047110 53 / 4978364
brain 110 / 506301 19 / 200215 114 / 729526 699 / 4997811 110 / 506301 19 / 200215 114 / 729526 699 / 4997811
cartilage 4 / 15965 10 / 37226 -- 10 / 778035 4 / 15965 10 / 37226 -- 10 / 778035
cerebellum 15 / 90353   31 / 90885 460 / 1495938 15 / 90353 0 / 0 31 / 90885 460 / 1495938
cerebrum 52 / 198932   -- -- 52 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 5 / 26551 36 / 151167 7 / 98089 49 / 643586 5 / 26551 36 / 151167 7 / 98089 49 / 643586
ear 4 / 16130 -- -- -- 4 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 50 / 246043   -- -- 50 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564   -- -- 3 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 27 / 128826 2 / 46440 10 / 85898 530 / 12434232 27 / 128826 2 / 46440 10 / 85898 530 / 12434232
gastrointestinal tract 5 / 28803   4 / 45908 -- 5 / 28803 0 / 12721 4 / 45908 --
heart 20 / 76442   9 / 83063 -- 20 / 76442 0 / 1 9 / 83063 --
kidney 13 / 106627 11 / 89898 7 / 155372 2 / 100281 13 / 106627 11 / 89898 7 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 7 / 96846 15 / 107249 5 / 66308 22 / 214987 7 / 96846 15 / 107249 5 / 66308 22 / 214987
lung 42 / 128150 26 / 170663 20 / 159917 8 / 159059 42 / 128150 26 / 170663 20 / 159917 8 / 159059
lymph node 17 / 62650 7 / 27007 2431 / 5278419 99 / 4863489 17 / 62650 7 / 27007 2431 / 5278419 99 / 4863489
lymphoreticular 2 / 17836 1 / 44303 -- -- 2 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 21 / 46553 12 / 104307 170 / 43166038 2053 / 30312656 21 / 46553 12 / 104307 170 / 43166038 2053 / 30312656
muscle 9 / 74039   5 / 107836 10 / 61270 9 / 74039 0 / 27691 5 / 107836 10 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 10 / 89988 2 / 94887 9 / 179472 1 / 11462 10 / 89988 2 / 94887 9 / 179472
pancreas   6 / 74930 8 / 85728 12 / 189999 0 / 7237 6 / 74930 8 / 85728 12 / 189999
pancreatic islet 9 / 96524 3 / 30072 -- -- 9 / 96524 3 / 30072 -- --
parathyroid   9 / 20557 -- -- 0 / 24 9 / 20557 -- --
peripheral nervous system 5 / 14891 1 / 645 -- -- 5 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 32 / 241088 6 / 39531 22 / 207348 -- 32 / 241088 6 / 39531 22 / 207348 --
pooled tissue 62 / 276455   -- -- 62 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 19 / 79993 15 / 107080 23 / 266949 40 / 491794 19 / 79993 15 / 107080 23 / 266949 40 / 491794
retina 11 / 29438 -- 164 / 820326 21 / 88490 11 / 29438 -- 164 / 820326 21 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 24 / 73633 9 / 125377 2451 / 26905847 1765 / 34522313 24 / 73633 9 / 125377 2451 / 26905847 1765 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 292 / 6230144 -- -- -- 292 / 6230144 --
stomach 10 / 26641 143 / 65644 24 / 124767 56 / 448716 10 / 26641 143 / 65644 24 / 124767 56 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 24 / 143630 13 / 100058 -- 557 / 12372003 24 / 143630 13 / 100058 -- 557 / 12372003
thymus 4 / 4478   -- -- 4 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 7 / 32606 15 / 115938 26 / 124664 1 / 11737 7 / 32606 15 / 115938 26 / 124664
uncharacterized tissue 21 / 207932 73 / 479819   7 / 51729 21 / 207932 73 / 479819 0 / 21833 7 / 51729
uterus 8 / 38063 13 / 133582 1897 / 10193077 -- 8 / 38063 13 / 133582 1897 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 768 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 768 / 13135050 --
white blood cells -- -- 50 / 846268 -- -- -- 50 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --