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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.500788Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 142 / 3316537 140 / 2498449 766 / 114162531 890 / 109592465 142 / 3316537 140 / 2498449 766 / 114162531 890 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     2 / 5047110 3 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 2 / 5047110 3 / 4978364
brain 14 / 506301 12 / 200215 5 / 729526 113 / 4997811 14 / 506301 12 / 200215 5 / 729526 113 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 4 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 4 / 778035
cerebellum 6 / 90353   1 / 90885 17 / 1495938 6 / 90353 0 / 0 1 / 90885 17 / 1495938
cerebrum 10 / 198932   -- -- 10 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 8 / 151167 1 / 98089 12 / 643586 1 / 26551 8 / 151167 1 / 98089 12 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 11 / 246043   -- -- 11 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 6 / 128826 6 / 46440   227 / 12434232 6 / 128826 6 / 46440 0 / 85898 227 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721   -- 1 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442   4 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 4 / 83063 --
kidney 6 / 106627 4 / 89898 2 / 155372 1 / 100281 6 / 106627 4 / 89898 2 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   8 / 107249 2 / 66308 3 / 214987 0 / 96846 8 / 107249 2 / 66308 3 / 214987
lung 1 / 128150 8 / 170663 2 / 159917   1 / 128150 8 / 170663 2 / 159917 0 / 159059
lymph node 7 / 62650   33 / 5278419 13 / 4863489 7 / 62650 0 / 27007 33 / 5278419 13 / 4863489
lymphoreticular   7 / 44303 -- -- 0 / 17836 7 / 44303 -- --
mammary gland 9 / 46553 9 / 104307 255 / 43166038 201 / 30312656 9 / 46553 9 / 104307 255 / 43166038 201 / 30312656
muscle 5 / 74039 5 / 27691 4 / 107836 1 / 61270 5 / 74039 5 / 27691 4 / 107836 1 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 7 / 89988     2 / 11462 7 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas   2 / 74930     0 / 7237 2 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 10 / 96524 2 / 30072 -- -- 10 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   5 / 20557 -- -- 0 / 24 5 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088 1 / 39531 1 / 207348 -- 3 / 241088 1 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 26 / 276455   -- -- 26 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 3 / 107080   6 / 491794 1 / 79993 3 / 107080 0 / 266949 6 / 491794
retina   -- 28 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 28 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 10 / 125377 133 / 26905847 185 / 34522313 4 / 73633 10 / 125377 133 / 26905847 185 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 59 / 6230144 -- -- -- 59 / 6230144 --
stomach         0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 1 / 100058 -- 98 / 12372003 2 / 143630 1 / 100058 -- 98 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 2 / 32606   4 / 124664 3 / 11737 2 / 32606 0 / 115938 4 / 124664
uncharacterized tissue 4 / 207932 22 / 479819   1 / 51729 4 / 207932 22 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 2 / 38063 11 / 133582 18 / 10193077 -- 2 / 38063 11 / 133582 18 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 205 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 205 / 13135050 --
white blood cells -- -- 11 / 846268 -- -- -- 11 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --