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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.499984Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 124 / 3316537 170 / 2498449 4363 / 114162531 7905 / 109592465 124 / 3316537 170 / 2498449 4363 / 114162531 7905 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 6 / 57865 --   1 / 16077 6 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     6 / 5047110 9 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 6 / 5047110 9 / 4978364
brain 11 / 506301 12 / 200215 13 / 729526 139 / 4997811 11 / 506301 12 / 200215 13 / 729526 139 / 4997811
cartilage     -- 17 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 17 / 778035
cerebellum 2 / 90353     36 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 0 / 90885 36 / 1495938
cerebrum 3 / 198932   -- -- 3 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   6 / 44577 -- -- 0 / 3888 6 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 12 / 151167 2 / 98089 4 / 643586 1 / 26551 12 / 151167 2 / 98089 4 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 9 / 246043   -- -- 9 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine   1 / 2857 -- -- 0 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 4 / 128826 1 / 46440   1002 / 12434232 4 / 128826 1 / 46440 0 / 85898 1002 / 12434232
gastrointestinal tract   2 / 12721   -- 0 / 28803 2 / 12721 0 / 45908 --
heart 6 / 76442   3 / 83063 -- 6 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 7 / 106627 4 / 89898 1 / 155372 1 / 100281 7 / 106627 4 / 89898 1 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 6 / 107249 2 / 66308 14 / 214987 2 / 96846 6 / 107249 2 / 66308 14 / 214987
lung 5 / 128150 12 / 170663 7 / 159917 5 / 159059 5 / 128150 12 / 170663 7 / 159917 5 / 159059
lymph node 6 / 62650 4 / 27007 650 / 5278419 207 / 4863489 6 / 62650 4 / 27007 650 / 5278419 207 / 4863489
lymphoreticular 2 / 17836 1 / 44303 -- -- 2 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 12 / 104307 228 / 43166038 3011 / 30312656 2 / 46553 12 / 104307 228 / 43166038 3011 / 30312656
muscle 4 / 74039     3 / 61270 4 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 3 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   13 / 89988 1 / 94887 2 / 179472 0 / 11462 13 / 89988 1 / 94887 2 / 179472
pancreas   6 / 74930   1 / 189999 0 / 7237 6 / 74930 0 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 12 / 96524   -- -- 12 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 4 / 241088   3 / 207348 -- 4 / 241088 0 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 13 / 276455   -- -- 13 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 4 / 107080 5 / 266949 2 / 491794 2 / 79993 4 / 107080 5 / 266949 2 / 491794
retina 2 / 29438 -- 39 / 820326 34 / 88490 2 / 29438 -- 39 / 820326 34 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 4 / 125377 2300 / 26905847 3031 / 34522313 4 / 73633 4 / 125377 2300 / 26905847 3031 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 234 / 6230144 -- -- -- 234 / 6230144 --
stomach   5 / 65644 1 / 124767 12 / 448716 0 / 26641 5 / 65644 1 / 124767 12 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 3 / 100058 -- 372 / 12372003 5 / 143630 3 / 100058 -- 372 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 4 / 11737 6 / 32606 5 / 115938   4 / 11737 6 / 32606 5 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 4 / 207932 33 / 479819   3 / 51729 4 / 207932 33 / 479819 0 / 21833 3 / 51729
uterus 7 / 38063 13 / 133582 278 / 10193077 -- 7 / 38063 13 / 133582 278 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 567 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 567 / 13135050 --
white blood cells -- -- 18 / 846268 -- -- -- 18 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --