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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.497599Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1379 / 3316537 812 / 2498449 1850 / 114162531 4830 / 109592465 1379 / 3316537 812 / 2498449 1850 / 114162531 4830 / 109592465
adrenal cortex -- 4 / 9928 -- -- -- 4 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 13 / 57865 -- 13 / 83577 2 / 16077 13 / 57865 -- 13 / 83577
bone marrow 3 / 14774 19 / 29891 16 / 5047110 37 / 4978364 3 / 14774 19 / 29891 16 / 5047110 37 / 4978364
brain 212 / 506301 55 / 200215 72 / 729526 392 / 4997811 212 / 506301 55 / 200215 72 / 729526 392 / 4997811
cartilage 35 / 15965 7 / 37226 -- 127 / 778035 35 / 15965 7 / 37226 -- 127 / 778035
cerebellum 13 / 90353   1 / 90885 56 / 1495938 13 / 90353 0 / 0 1 / 90885 56 / 1495938
cerebrum 68 / 198932 1 / 3422 -- -- 68 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix 2 / 3888 62 / 44577 -- -- 2 / 3888 62 / 44577 -- --
colon 6 / 26551 34 / 151167 6 / 98089 82 / 643586 6 / 26551 34 / 151167 6 / 98089 82 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 41 / 246043   -- -- 41 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564 1 / 2857 -- -- 3 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   12 / 17290 -- -- 0 / 270 12 / 17290 -- --
eye 20 / 128826 4 / 46440 5 / 85898 407 / 12434232 20 / 128826 4 / 46440 5 / 85898 407 / 12434232
gastrointestinal tract 25 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 -- 25 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 --
heart 30 / 76442   4 / 83063 -- 30 / 76442 0 / 1 4 / 83063 --
kidney 30 / 106627 18 / 89898 14 / 155372 19 / 100281 30 / 106627 18 / 89898 14 / 155372 19 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 13 / 96846 41 / 107249   15 / 214987 13 / 96846 41 / 107249 0 / 66308 15 / 214987
lung 128 / 128150 47 / 170663 31 / 159917 31 / 159059 128 / 128150 47 / 170663 31 / 159917 31 / 159059
lymph node 13 / 62650 9 / 27007 77 / 5278419 35 / 4863489 13 / 62650 9 / 27007 77 / 5278419 35 / 4863489
lymphoreticular   47 / 44303 -- -- 0 / 17836 47 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 22 / 104307 247 / 43166038 932 / 30312656 3 / 46553 22 / 104307 247 / 43166038 932 / 30312656
muscle 7 / 74039 12 / 27691 6 / 107836 5 / 61270 7 / 74039 12 / 27691 6 / 107836 5 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 3 / 89988 12 / 94887 54 / 179472 2 / 11462 3 / 89988 12 / 94887 54 / 179472
pancreas   6 / 74930 29 / 85728 38 / 189999 0 / 7237 6 / 74930 29 / 85728 38 / 189999
pancreatic islet 12 / 96524 20 / 30072 -- -- 12 / 96524 20 / 30072 -- --
parathyroid   5 / 20557 -- -- 0 / 24 5 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 214 / 241088 5 / 39531 17 / 207348 -- 214 / 241088 5 / 39531 17 / 207348 --
pooled tissue 45 / 276455   -- -- 45 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 16 / 79993 12 / 107080 5 / 266949 37 / 491794 16 / 79993 12 / 107080 5 / 266949 37 / 491794
retina 2 / 29438 -- 63 / 820326 3 / 88490 2 / 29438 -- 63 / 820326 3 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 29 / 73633 35 / 125377 359 / 26905847 1717 / 34522313 29 / 73633 35 / 125377 359 / 26905847 1717 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 77 / 52939   -- -- 77 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 169 / 6230144 -- -- -- 169 / 6230144 --
stomach 18 / 26641 31 / 65644 12 / 124767 78 / 448716 18 / 26641 31 / 65644 12 / 124767 78 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 45 / 143630 31 / 100058 -- 697 / 12372003 45 / 143630 31 / 100058 -- 697 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 5 / 11737 18 / 32606 18 / 115938 53 / 124664 5 / 11737 18 / 32606 18 / 115938 53 / 124664
uncharacterized tissue 175 / 207932 180 / 479819 4 / 21833 2 / 51729 175 / 207932 180 / 479819 4 / 21833 2 / 51729
uterus 10 / 38063 55 / 133582 166 / 10193077 -- 10 / 38063 55 / 133582 166 / 10193077 --
vascular 58 / 46250 -- 320 / 13135050 -- 58 / 46250 -- 320 / 13135050 --
white blood cells -- -- 195 / 846268 -- -- -- 195 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --