Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.495710Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 685 / 3316537 127 / 2498449 1438 / 114162531 4976 / 109592465 685 / 3316537 127 / 2498449 1438 / 114162531 4976 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 --   0 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 332 / 506301 59 / 200215 72 / 729526 1060 / 4997811 332 / 506301 59 / 200215 72 / 729526 1060 / 4997811
cartilage 1 / 15965 1 / 37226 --   1 / 15965 1 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 51 / 90353   26 / 90885 19 / 1495938 51 / 90353 0 / 0 26 / 90885 19 / 1495938
cerebrum 205 / 198932   -- -- 205 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   1 / 151167     0 / 26551 1 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear 17 / 16130 -- -- -- 17 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 17 / 246043   -- -- 17 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine   1 / 2857 -- -- 0 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 9 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 1375 / 12434232 9 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 1375 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442     -- 1 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 2 / 106627 7 / 89898 1 / 155372 1 / 100281 2 / 106627 7 / 89898 1 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver       1 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 4 / 128150 1 / 170663 1 / 159917   4 / 128150 1 / 170663 1 / 159917 0 / 159059
lymph node   1 / 27007     0 / 62650 1 / 27007 0 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 239 / 43166038 204 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 239 / 43166038 204 / 30312656
muscle 1 / 74039       1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 7 / 10333   -- -- 7 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 4 / 89988     1 / 11462 4 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 11 / 14891   -- -- 11 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta   1 / 39531   -- 0 / 241088 1 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 5 / 276455   -- -- 5 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   1 / 107080   1 / 491794 0 / 79993 1 / 107080 0 / 266949 1 / 491794
retina 4 / 29438 -- 32 / 820326 1 / 88490 4 / 29438 -- 32 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 6 / 73633 15 / 125377 805 / 26905847 2215 / 34522313 6 / 73633 15 / 125377 805 / 26905847 2215 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 247 / 6230144 -- -- -- 247 / 6230144 --
stomach 1 / 26641       1 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 10 / 100058 -- 98 / 12372003 3 / 143630 10 / 100058 -- 98 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 16 / 479819   1 / 51729 1 / 207932 16 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus   4 / 133582 7 / 10193077 -- 0 / 38063 4 / 133582 7 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 5 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 5 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1 / 846268 -- -- -- 1 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --