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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.491351Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 834 / 3316537 563 / 2498449 6954 / 114162531 13676 / 109592465 834 / 3316537 563 / 2498449 6954 / 114162531 13676 / 109592465
adrenal cortex -- 4 / 9928 -- -- -- 4 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 5 / 16077 9 / 57865 --   5 / 16077 9 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 7 / 29891 4 / 5047110 121 / 4978364 1 / 14774 7 / 29891 4 / 5047110 121 / 4978364
brain 164 / 506301 22 / 200215 50 / 729526 580 / 4997811 164 / 506301 22 / 200215 50 / 729526 580 / 4997811
cartilage 4 / 15965 14 / 37226 -- 70 / 778035 4 / 15965 14 / 37226 -- 70 / 778035
cerebellum 30 / 90353   11 / 90885 144 / 1495938 30 / 90353 0 / 0 11 / 90885 144 / 1495938
cerebrum 89 / 198932 2 / 3422 -- -- 89 / 198932 2 / 3422 -- --
cervix   4 / 44577 -- -- 0 / 3888 4 / 44577 -- --
colon 12 / 26551 37 / 151167 5 / 98089 40 / 643586 12 / 26551 37 / 151167 5 / 98089 40 / 643586
ear 4 / 16130 -- -- -- 4 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 95 / 246043   -- -- 95 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 6 / 19564 2 / 2857 -- -- 6 / 19564 2 / 2857 -- --
esophagus   5 / 17290 -- -- 0 / 270 5 / 17290 -- --
eye 12 / 128826 7 / 46440 4 / 85898 1318 / 12434232 12 / 128826 7 / 46440 4 / 85898 1318 / 12434232
gastrointestinal tract 7 / 28803 5 / 12721 2 / 45908 -- 7 / 28803 5 / 12721 2 / 45908 --
heart 14 / 76442   1 / 83063 -- 14 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 17 / 106627 23 / 89898 14 / 155372 1 / 100281 17 / 106627 23 / 89898 14 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 12 / 96846 47 / 107249 8 / 66308 3 / 214987 12 / 96846 47 / 107249 8 / 66308 3 / 214987
lung 42 / 128150 21 / 170663 10 / 159917 6 / 159059 42 / 128150 21 / 170663 10 / 159917 6 / 159059
lymph node 29 / 62650 1 / 27007 309 / 5278419 66 / 4863489 29 / 62650 1 / 27007 309 / 5278419 66 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 1 / 44303 -- -- 1 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 13 / 46553 39 / 104307 1062 / 43166038 2235 / 30312656 13 / 46553 39 / 104307 1062 / 43166038 2235 / 30312656
muscle 44 / 74039 1 / 27691 2 / 107836 1 / 61270 44 / 74039 1 / 27691 2 / 107836 1 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 16 / 89988 7 / 94887 20 / 179472 1 / 11462 16 / 89988 7 / 94887 20 / 179472
pancreas 1 / 7237 11 / 74930 1 / 85728 17 / 189999 1 / 7237 11 / 74930 1 / 85728 17 / 189999
pancreatic islet 13 / 96524   -- -- 13 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   6 / 20557 -- -- 0 / 24 6 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 43 / 241088 13 / 39531 19 / 207348 -- 43 / 241088 13 / 39531 19 / 207348 --
pooled tissue 21 / 276455   -- -- 21 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 7 / 79993 17 / 107080 4 / 266949 51 / 491794 7 / 79993 17 / 107080 4 / 266949 51 / 491794
retina 3 / 29438 -- 49 / 820326 3 / 88490 3 / 29438 -- 49 / 820326 3 / 88490
salivary gland 2 / 2490   -- -- 2 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 19 / 73633 48 / 125377 2058 / 26905847 7253 / 34522313 19 / 73633 48 / 125377 2058 / 26905847 7253 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 10 / 52939   -- -- 10 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 838 / 6230144 -- -- -- 838 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 6 / 65644 13 / 124767 54 / 448716 2 / 26641 6 / 65644 13 / 124767 54 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 26 / 143630 41 / 100058 -- 1672 / 12372003 26 / 143630 41 / 100058 -- 1672 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   17 / 32606 5 / 115938 17 / 124664 0 / 11737 17 / 32606 5 / 115938 17 / 124664
uncharacterized tissue 40 / 207932 115 / 479819   4 / 51729 40 / 207932 115 / 479819 0 / 21833 4 / 51729
uterus 17 / 38063 22 / 133582 646 / 10193077 -- 17 / 38063 22 / 133582 646 / 10193077 --
vascular 18 / 46250 -- 1798 / 13135050 -- 18 / 46250 -- 1798 / 13135050 --
white blood cells -- -- 34 / 846268 -- -- -- 34 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --