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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.490203Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 934 / 3316537 411 / 2498449 10989 / 114162531 9184 / 109592465 934 / 3316537 411 / 2498449 10989 / 114162531 9184 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 22 / 16077 14 / 57865 -- 4 / 83577 22 / 16077 14 / 57865 -- 4 / 83577
bone marrow 16 / 14774   64 / 5047110 211 / 4978364 16 / 14774 0 / 29891 64 / 5047110 211 / 4978364
brain 78 / 506301 26 / 200215 130 / 729526 640 / 4997811 78 / 506301 26 / 200215 130 / 729526 640 / 4997811
cartilage 8 / 15965 21 / 37226 -- 168 / 778035 8 / 15965 21 / 37226 -- 168 / 778035
cerebellum 14 / 90353   8 / 90885 155 / 1495938 14 / 90353 0 / 0 8 / 90885 155 / 1495938
cerebrum 28 / 198932   -- -- 28 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 2 / 3888 7 / 44577 -- -- 2 / 3888 7 / 44577 -- --
colon 11 / 26551 25 / 151167 4 / 98089 28 / 643586 11 / 26551 25 / 151167 4 / 98089 28 / 643586
ear 9 / 16130 -- -- -- 9 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 105 / 246043   -- -- 105 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564 1 / 2857 -- -- 1 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 24 / 128826 1 / 46440 13 / 85898 401 / 12434232 24 / 128826 1 / 46440 13 / 85898 401 / 12434232
gastrointestinal tract 23 / 28803   1 / 45908 -- 23 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 16 / 76442   12 / 83063 -- 16 / 76442 0 / 1 12 / 83063 --
kidney 59 / 106627 15 / 89898 14 / 155372 2 / 100281 59 / 106627 15 / 89898 14 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 38 / 96846 23 / 107249 8 / 66308 3 / 214987 38 / 96846 23 / 107249 8 / 66308 3 / 214987
lung 22 / 128150 27 / 170663 18 / 159917 6 / 159059 22 / 128150 27 / 170663 18 / 159917 6 / 159059
lymph node     139 / 5278419 4 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 139 / 5278419 4 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 17 / 46553 16 / 104307 5734 / 43166038 2376 / 30312656 17 / 46553 16 / 104307 5734 / 43166038 2376 / 30312656
muscle 53 / 74039 1 / 27691 2 / 107836 3 / 61270 53 / 74039 1 / 27691 2 / 107836 3 / 61270
nervous 5 / 10333   -- -- 5 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 21 / 89988 14 / 94887 21 / 179472 3 / 11462 21 / 89988 14 / 94887 21 / 179472
pancreas 2 / 7237 16 / 74930 1 / 85728 31 / 189999 2 / 7237 16 / 74930 1 / 85728 31 / 189999
pancreatic islet 12 / 96524 6 / 30072 -- -- 12 / 96524 6 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 9 / 14891 1 / 645 -- -- 9 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 82 / 241088   24 / 207348 -- 82 / 241088 0 / 39531 24 / 207348 --
pooled tissue 38 / 276455   -- -- 38 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 40 / 79993 21 / 107080 74 / 266949 121 / 491794 40 / 79993 21 / 107080 74 / 266949 121 / 491794
retina 1 / 29438 -- 21 / 820326 8 / 88490 1 / 29438 -- 21 / 820326 8 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 51 / 73633 13 / 125377 742 / 26905847 3682 / 34522313 51 / 73633 13 / 125377 742 / 26905847 3682 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 26 / 52939   -- -- 26 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 354 / 6230144 -- -- -- 354 / 6230144 --
stomach 6 / 26641 30 / 65644 21 / 124767 101 / 448716 6 / 26641 30 / 65644 21 / 124767 101 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 19 / 143630 33 / 100058 -- 1199 / 12372003 19 / 143630 33 / 100058 -- 1199 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 4 / 32606 13 / 115938 15 / 124664 3 / 11737 4 / 32606 13 / 115938 15 / 124664
uncharacterized tissue 22 / 207932 64 / 479819 1 / 21833 5 / 51729 22 / 207932 64 / 479819 1 / 21833 5 / 51729
uterus 12 / 38063 19 / 133582 2835 / 10193077 -- 12 / 38063 19 / 133582 2835 / 10193077 --
vascular 51 / 46250 -- 719 / 13135050 -- 51 / 46250 -- 719 / 13135050 --
white blood cells -- -- 23 / 846268 -- -- -- 23 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --