Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.487933Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 113 / 3316537 70 / 2498449 2331 / 114162531 4305 / 109592465 113 / 3316537 70 / 2498449 2331 / 114162531 4305 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   2 / 57865 --   0 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     28 / 5047110 68 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 28 / 5047110 68 / 4978364
brain 9 / 506301 2 / 200215 11 / 729526 92 / 4997811 9 / 506301 2 / 200215 11 / 729526 92 / 4997811
cartilage     -- 12 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 12 / 778035
cerebellum     2 / 90885 14 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 2 / 90885 14 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   6 / 44577 -- -- 0 / 3888 6 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 5 / 151167   5 / 643586 1 / 26551 5 / 151167 0 / 98089 5 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 8 / 246043   -- -- 8 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 5 / 128826   1 / 85898 701 / 12434232 5 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 701 / 12434232
gastrointestinal tract     1 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 4 / 76442   1 / 83063 -- 4 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 2 / 106627 2 / 89898 3 / 155372   2 / 106627 2 / 89898 3 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 5 / 107249 1 / 66308 3 / 214987 2 / 96846 5 / 107249 1 / 66308 3 / 214987
lung 6 / 128150 4 / 170663 1 / 159917 1 / 159059 6 / 128150 4 / 170663 1 / 159917 1 / 159059
lymph node 10 / 62650 2 / 27007 177 / 5278419 211 / 4863489 10 / 62650 2 / 27007 177 / 5278419 211 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836   -- -- 1 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 247 / 43166038 606 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 247 / 43166038 606 / 30312656
muscle 14 / 74039 1 / 27691 2 / 107836   14 / 74039 1 / 27691 2 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   4 / 89988   1 / 179472 0 / 11462 4 / 89988 0 / 94887 1 / 179472
pancreas   2 / 74930   4 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 0 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet 16 / 96524   -- -- 16 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 4 / 241088   2 / 207348 -- 4 / 241088 0 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 14 / 276455   -- -- 14 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     6 / 266949 8 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 6 / 266949 8 / 491794
retina   -- 10 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 10 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   3 / 125377 1031 / 26905847 2145 / 34522313 0 / 73633 3 / 125377 1031 / 26905847 2145 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 242 / 6230144 -- -- -- 242 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 2 / 65644 3 / 124767 8 / 448716 1 / 26641 2 / 65644 3 / 124767 8 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 4 / 143630 2 / 100058 -- 420 / 12372003 4 / 143630 2 / 100058 -- 420 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737   1 / 115938 4 / 124664 1 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 4 / 124664
uncharacterized tissue 4 / 207932 23 / 479819   1 / 51729 4 / 207932 23 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus   4 / 133582 355 / 10193077 -- 0 / 38063 4 / 133582 355 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 201 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 201 / 13135050 --
white blood cells -- -- 5 / 846268 -- -- -- 5 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --