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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.486360Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 542 / 3316537 304 / 2498449 58380 / 114162531 61519 / 109592465 542 / 3316537 304 / 2498449 58380 / 114162531 61519 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   7 / 57865 --   0 / 16077 7 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 12 / 14774 20 / 29891 3265 / 5047110 2282 / 4978364 12 / 14774 20 / 29891 3265 / 5047110 2282 / 4978364
brain 18 / 506301 24 / 200215 228 / 729526 3118 / 4997811 18 / 506301 24 / 200215 228 / 729526 3118 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 113 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 113 / 778035
cerebellum 2 / 90353   26 / 90885 1096 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 26 / 90885 1096 / 1495938
cerebrum 2 / 198932   -- -- 2 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 9 / 26551 12 / 151167 27 / 98089 430 / 643586 9 / 26551 12 / 151167 27 / 98089 430 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 28 / 246043   -- -- 28 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 5 / 19564 3 / 2857 -- -- 5 / 19564 3 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 15 / 128826 2 / 46440 14 / 85898 6518 / 12434232 15 / 128826 2 / 46440 14 / 85898 6518 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803 2 / 12721 19 / 45908 -- 2 / 28803 2 / 12721 19 / 45908 --
heart 29 / 76442   227 / 83063 -- 29 / 76442 0 / 1 227 / 83063 --
kidney 13 / 106627 22 / 89898 56 / 155372 188 / 100281 13 / 106627 22 / 89898 56 / 155372 188 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 25 / 96846 3 / 107249 50 / 66308 163 / 214987 25 / 96846 3 / 107249 50 / 66308 163 / 214987
lung 20 / 128150 18 / 170663 113 / 159917 61 / 159059 20 / 128150 18 / 170663 113 / 159917 61 / 159059
lymph node 12 / 62650 6 / 27007 12935 / 5278419 9816 / 4863489 12 / 62650 6 / 27007 12935 / 5278419 9816 / 4863489
lymphoreticular 5 / 17836 2 / 44303 -- -- 5 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 7 / 46553 18 / 104307 11835 / 43166038 12577 / 30312656 7 / 46553 18 / 104307 11835 / 43166038 12577 / 30312656
muscle 31 / 74039   52 / 107836 34 / 61270 31 / 74039 0 / 27691 52 / 107836 34 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   7 / 89988 56 / 94887 34 / 179472 0 / 11462 7 / 89988 56 / 94887 34 / 179472
pancreas 5 / 7237 7 / 74930 45 / 85728 84 / 189999 5 / 7237 7 / 74930 45 / 85728 84 / 189999
pancreatic islet 11 / 96524 7 / 30072 -- -- 11 / 96524 7 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 4 / 13260 1 / 1358 -- -- 4 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 7 / 241088 3 / 39531 148 / 207348 -- 7 / 241088 3 / 39531 148 / 207348 --
pooled tissue 133 / 276455   -- -- 133 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 9 / 79993 24 / 107080 336 / 266949 319 / 491794 9 / 79993 24 / 107080 336 / 266949 319 / 491794
retina 2 / 29438 -- 419 / 820326 172 / 88490 2 / 29438 -- 419 / 820326 172 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 7 / 73633 15 / 125377 11578 / 26905847 16117 / 34522313 7 / 73633 15 / 125377 11578 / 26905847 16117 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1938 / 6230144 -- -- -- 1938 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 7 / 65644 54 / 124767 315 / 448716 3 / 26641 7 / 65644 54 / 124767 315 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 14 / 143630 9 / 100058 -- 7823 / 12372003 14 / 143630 9 / 100058 -- 7823 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 1 / 32606 98 / 115938 148 / 124664 2 / 11737 1 / 32606 98 / 115938 148 / 124664
uncharacterized tissue 67 / 207932 67 / 479819 11 / 21833 111 / 51729 67 / 207932 67 / 479819 11 / 21833 111 / 51729
uterus 24 / 38063 8 / 133582 6668 / 10193077 -- 24 / 38063 8 / 133582 6668 / 10193077 --
vascular 11 / 46250 -- 7915 / 13135050 -- 11 / 46250 -- 7915 / 13135050 --
white blood cells -- -- 267 / 846268 -- -- -- 267 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --