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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.483486Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 219 / 3316537 141 / 2498449 3011 / 114162531 2246 / 109592465 219 / 3316537 141 / 2498449 3011 / 114162531 2246 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   2 / 29891 28 / 5047110   0 / 14774 2 / 29891 28 / 5047110 0 / 4978364
brain 15 / 506301 18 / 200215 11 / 729526 156 / 4997811 15 / 506301 18 / 200215 11 / 729526 156 / 4997811
cartilage   1 / 37226 --   0 / 15965 1 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 3 / 90353   2 / 90885 50 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 2 / 90885 50 / 1495938
cerebrum 10 / 198932   -- -- 10 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 9 / 151167   6 / 643586 2 / 26551 9 / 151167 0 / 98089 6 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 38 / 246043   -- -- 38 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 10 / 128826 2 / 46440 1 / 85898 410 / 12434232 10 / 128826 2 / 46440 1 / 85898 410 / 12434232
gastrointestinal tract   1 / 12721   -- 0 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 8 / 106627 5 / 89898 4 / 155372 1 / 100281 8 / 106627 5 / 89898 4 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 6 / 107249   2 / 214987 3 / 96846 6 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 13 / 128150 8 / 170663 5 / 159917 1 / 159059 13 / 128150 8 / 170663 5 / 159917 1 / 159059
lymph node 8 / 62650 3 / 27007 211 / 5278419 116 / 4863489 8 / 62650 3 / 27007 211 / 5278419 116 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 8 / 46553 12 / 104307 33 / 43166038 326 / 30312656 8 / 46553 12 / 104307 33 / 43166038 326 / 30312656
muscle 8 / 74039     1 / 61270 8 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   6 / 89988 2 / 94887 6 / 179472 0 / 11462 6 / 89988 2 / 94887 6 / 179472
pancreas   1 / 74930 1 / 85728 1 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 1 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 9 / 96524 1 / 30072 -- -- 9 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 11 / 241088 3 / 39531 7 / 207348 -- 11 / 241088 3 / 39531 7 / 207348 --
pooled tissue 21 / 276455   -- -- 21 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993 1 / 107080 6 / 266949 7 / 491794 4 / 79993 1 / 107080 6 / 266949 7 / 491794
retina 2 / 29438 -- 22 / 820326 8 / 88490 2 / 29438 -- 22 / 820326 8 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 11 / 73633 8 / 125377 1140 / 26905847 871 / 34522313 11 / 73633 8 / 125377 1140 / 26905847 871 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 317 / 6230144 -- -- -- 317 / 6230144 --
stomach   4 / 65644 3 / 124767 5 / 448716 0 / 26641 4 / 65644 3 / 124767 5 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 8 / 143630 4 / 100058 -- 278 / 12372003 8 / 143630 4 / 100058 -- 278 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 2 / 115938 1 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 2 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 10 / 207932 26 / 479819     10 / 207932 26 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 3 / 38063 14 / 133582 562 / 10193077 -- 3 / 38063 14 / 133582 562 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 644 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 644 / 13135050 --
white blood cells -- -- 9 / 846268 -- -- -- 9 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --