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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.483454Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 404 / 3316537 243 / 2498449 9405 / 114162531 5523 / 109592465 404 / 3316537 243 / 2498449 9405 / 114162531 5523 / 109592465
adrenal cortex -- 4 / 9928 -- -- -- 4 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 9 / 57865 -- 3 / 83577 1 / 16077 9 / 57865 -- 3 / 83577
bone marrow 1 / 14774 1 / 29891   9 / 4978364 1 / 14774 1 / 29891 0 / 5047110 9 / 4978364
brain 63 / 506301 29 / 200215 126 / 729526 1241 / 4997811 63 / 506301 29 / 200215 126 / 729526 1241 / 4997811
cartilage 1 / 15965 2 / 37226 -- 95 / 778035 1 / 15965 2 / 37226 -- 95 / 778035
cerebellum       150 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 150 / 1495938
cerebrum 25 / 198932   -- -- 25 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 3 / 3888 3 / 44577 -- -- 3 / 3888 3 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 9 / 151167   24 / 643586 3 / 26551 9 / 151167 0 / 98089 24 / 643586
ear 6 / 16130 -- -- -- 6 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 49 / 246043   -- -- 49 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 10 / 19564 2 / 2857 -- -- 10 / 19564 2 / 2857 -- --
esophagus   10 / 17290 -- -- 0 / 270 10 / 17290 -- --
eye 24 / 128826 1 / 46440 15 / 85898 700 / 12434232 24 / 128826 1 / 46440 15 / 85898 700 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803   1 / 45908 -- 2 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 9 / 76442   1 / 83063 -- 9 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 17 / 106627 10 / 89898 18 / 155372 3 / 100281 17 / 106627 10 / 89898 18 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 10 / 107249 3 / 66308 4 / 214987 5 / 96846 10 / 107249 3 / 66308 4 / 214987
lung 35 / 128150 8 / 170663 16 / 159917 9 / 159059 35 / 128150 8 / 170663 16 / 159917 9 / 159059
lymph node     50 / 5278419 3 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 50 / 5278419 3 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 5 / 46553 7 / 104307 6061 / 43166038 1551 / 30312656 5 / 46553 7 / 104307 6061 / 43166038 1551 / 30312656
muscle 5 / 74039 3 / 27691   11 / 61270 5 / 74039 3 / 27691 0 / 107836 11 / 61270
nervous 12 / 10333   -- -- 12 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 4 / 89988 9 / 94887 24 / 179472 1 / 11462 4 / 89988 9 / 94887 24 / 179472
pancreas   12 / 74930 2 / 85728 13 / 189999 0 / 7237 12 / 74930 2 / 85728 13 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524 2 / 30072 -- -- 1 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 6 / 14891   -- -- 6 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland   1 / 1358 -- -- 0 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 35 / 241088 5 / 39531 18 / 207348 -- 35 / 241088 5 / 39531 18 / 207348 --
pooled tissue 13 / 276455   -- -- 13 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 5 / 107080 9 / 266949 6 / 491794 5 / 79993 5 / 107080 9 / 266949 6 / 491794
retina 1 / 29438 -- 50 / 820326 8 / 88490 1 / 29438 -- 50 / 820326 8 / 88490
salivary gland 1 / 2490 1 / 10368 -- -- 1 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 6 / 73633 32 / 125377 948 / 26905847 971 / 34522313 6 / 73633 32 / 125377 948 / 26905847 971 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 497 / 6230144 -- -- -- 497 / 6230144 --
stomach   6 / 65644 2 / 124767 11 / 448716 0 / 26641 6 / 65644 2 / 124767 11 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 10 / 143630 11 / 100058 -- 668 / 12372003 10 / 143630 11 / 100058 -- 668 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 16 / 115938 15 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 16 / 115938 15 / 124664
uncharacterized tissue 27 / 207932 38 / 479819 1 / 21833 4 / 51729 27 / 207932 38 / 479819 1 / 21833 4 / 51729
uterus 13 / 38063 15 / 133582 787 / 10193077 -- 13 / 38063 15 / 133582 787 / 10193077 --
vascular 5 / 46250 -- 774 / 13135050 -- 5 / 46250 -- 774 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1 / 846268 -- -- -- 1 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --