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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.481022Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 255 / 3316537 214 / 2498449 2610 / 114162531 5078 / 109592465 255 / 3316537 214 / 2498449 2610 / 114162531 5078 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 2 / 57865 -- 2 / 83577 1 / 16077 2 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow     19 / 5047110 1 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 19 / 5047110 1 / 4978364
brain 28 / 506301 20 / 200215 8 / 729526 221 / 4997811 28 / 506301 20 / 200215 8 / 729526 221 / 4997811
cartilage   14 / 37226 -- 21 / 778035 0 / 15965 14 / 37226 -- 21 / 778035
cerebellum 1 / 90353     6 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 0 / 90885 6 / 1495938
cerebrum 11 / 198932   -- -- 11 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 10 / 151167     2 / 26551 10 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 39 / 246043   -- -- 39 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   6 / 17290 -- -- 0 / 270 6 / 17290 -- --
eye 14 / 128826 23 / 46440 14 / 85898 158 / 12434232 14 / 128826 23 / 46440 14 / 85898 158 / 12434232
gastrointestinal tract 28 / 28803     -- 28 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 23 / 76442     -- 23 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 2 / 106627 2 / 89898     2 / 106627 2 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver       1 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 6 / 128150 5 / 170663 2 / 159917 5 / 159059 6 / 128150 5 / 170663 2 / 159917 5 / 159059
lymph node     3 / 5278419 2 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 3 / 5278419 2 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 5 / 46553 12 / 104307 216 / 43166038 2598 / 30312656 5 / 46553 12 / 104307 216 / 43166038 2598 / 30312656
muscle 2 / 74039     4 / 61270 2 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 4 / 61270
nervous 6 / 10333   -- -- 6 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 7 / 89988   6 / 179472 1 / 11462 7 / 89988 0 / 94887 6 / 179472
pancreas   33 / 74930   12 / 189999 0 / 7237 33 / 74930 0 / 85728 12 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524 10 / 30072 -- -- 5 / 96524 10 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 6 / 241088     -- 6 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 18 / 276455   -- -- 18 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 10 / 79993   9 / 266949 2 / 491794 10 / 79993 0 / 107080 9 / 266949 2 / 491794
retina 2 / 29438 -- 2 / 820326   2 / 29438 -- 2 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 6 / 73633   1434 / 26905847 725 / 34522313 6 / 73633 0 / 125377 1434 / 26905847 725 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 873 / 6230144 -- -- -- 873 / 6230144 --
stomach 6 / 26641 11 / 65644   8 / 448716 6 / 26641 11 / 65644 0 / 124767 8 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 35 / 100058 -- 1306 / 12372003 2 / 143630 35 / 100058 -- 1306 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737       2 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 13 / 207932 13 / 479819     13 / 207932 13 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 2 / 38063 11 / 133582 19 / 10193077 -- 2 / 38063 11 / 133582 19 / 10193077 --
vascular 10 / 46250 -- 8 / 13135050 -- 10 / 46250 -- 8 / 13135050 --
white blood cells -- -- 3 / 846268 -- -- -- 3 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --