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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.479808Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 470 / 3316537 282 / 2498449 64796 / 114162531 78604 / 109592465 470 / 3316537 282 / 2498449 64796 / 114162531 78604 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 7 / 57865 -- 4 / 83577 1 / 16077 7 / 57865 -- 4 / 83577
bone marrow 9 / 14774 2 / 29891 108 / 5047110 40 / 4978364 9 / 14774 2 / 29891 108 / 5047110 40 / 4978364
brain 48 / 506301 23 / 200215 250 / 729526 4558 / 4997811 48 / 506301 23 / 200215 250 / 729526 4558 / 4997811
cartilage 1 / 15965 5 / 37226 -- 599 / 778035 1 / 15965 5 / 37226 -- 599 / 778035
cerebellum     3 / 90885 673 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 3 / 90885 673 / 1495938
cerebrum 19 / 198932   -- -- 19 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888   -- -- 1 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 20 / 151167 1 / 98089 9 / 643586 3 / 26551 20 / 151167 1 / 98089 9 / 643586
ear 5 / 16130 -- -- -- 5 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 14 / 246043   -- -- 14 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 57 / 128826   14 / 85898 7826 / 12434232 57 / 128826 0 / 46440 14 / 85898 7826 / 12434232
gastrointestinal tract 23 / 28803   7 / 45908 -- 23 / 28803 0 / 12721 7 / 45908 --
heart 10 / 76442   163 / 83063 -- 10 / 76442 0 / 1 163 / 83063 --
kidney 7 / 106627 17 / 89898 181 / 155372 15 / 100281 7 / 106627 17 / 89898 181 / 155372 15 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 7 / 96846   47 / 66308 176 / 214987 7 / 96846 0 / 107249 47 / 66308 176 / 214987
lung 20 / 128150 15 / 170663 145 / 159917 38 / 159059 20 / 128150 15 / 170663 145 / 159917 38 / 159059
lymph node   5 / 27007 1900 / 5278419 854 / 4863489 0 / 62650 5 / 27007 1900 / 5278419 854 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836   -- -- 1 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   5 / 104307 3768 / 43166038 13589 / 30312656 0 / 46553 5 / 104307 3768 / 43166038 13589 / 30312656
muscle 1 / 74039 1 / 27691 16 / 107836 28 / 61270 1 / 74039 1 / 27691 16 / 107836 28 / 61270
nervous 3 / 10333   -- -- 3 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 6 / 89988 203 / 94887 70 / 179472 3 / 11462 6 / 89988 203 / 94887 70 / 179472
pancreas 5 / 7237 17 / 74930 15 / 85728 95 / 189999 5 / 7237 17 / 74930 15 / 85728 95 / 189999
pancreatic islet 85 / 96524 21 / 30072 -- -- 85 / 96524 21 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 5 / 14891   -- -- 5 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 21 / 241088   47 / 207348 -- 21 / 241088 0 / 39531 47 / 207348 --
pooled tissue 23 / 276455   -- -- 23 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993 5 / 107080 204 / 266949 67 / 491794 4 / 79993 5 / 107080 204 / 266949 67 / 491794
retina   -- 99 / 820326 43 / 88490 0 / 29438 -- 99 / 820326 43 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 17 / 73633 6 / 125377 24158 / 26905847 48590 / 34522313 17 / 73633 6 / 125377 24158 / 26905847 48590 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 190 / 6230144 -- -- -- 190 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 15 / 65644 29 / 124767 312 / 448716 2 / 26641 15 / 65644 29 / 124767 312 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 30 / 143630 1 / 100058 -- 863 / 12372003 30 / 143630 1 / 100058 -- 863 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 2 / 32606 281 / 115938 135 / 124664 2 / 11737 2 / 32606 281 / 115938 135 / 124664
uncharacterized tissue 6 / 207932 82 / 479819 1 / 21833 20 / 51729 6 / 207932 82 / 479819 1 / 21833 20 / 51729
uterus 9 / 38063 24 / 133582 6706 / 10193077 -- 9 / 38063 24 / 133582 6706 / 10193077 --
vascular 20 / 46250 -- 26229 / 13135050 -- 20 / 46250 -- 26229 / 13135050 --
white blood cells -- -- 31 / 846268 -- -- -- 31 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --