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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.478199Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 95 / 3316537 80 / 2498449 7047 / 114162531 9417 / 109592465 95 / 3316537 80 / 2498449 7047 / 114162531 9417 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   2 / 57865 --   0 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 3 / 29891 12 / 5047110 5 / 4978364 1 / 14774 3 / 29891 12 / 5047110 5 / 4978364
brain 8 / 506301 3 / 200215 21 / 729526 365 / 4997811 8 / 506301 3 / 200215 21 / 729526 365 / 4997811
cartilage   3 / 37226 -- 11 / 778035 0 / 15965 3 / 37226 -- 11 / 778035
cerebellum     1 / 90885 193 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 193 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon   4 / 151167   42 / 643586 0 / 26551 4 / 151167 0 / 98089 42 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 17 / 246043   -- -- 17 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 7 / 128826 2 / 46440 1 / 85898 1273 / 12434232 7 / 128826 2 / 46440 1 / 85898 1273 / 12434232
gastrointestinal tract   2 / 12721   -- 0 / 28803 2 / 12721 0 / 45908 --
heart 3 / 76442   2 / 83063 -- 3 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 3 / 106627   20 / 155372 1 / 100281 3 / 106627 0 / 89898 20 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 3 / 107249 5 / 66308 7 / 214987 2 / 96846 3 / 107249 5 / 66308 7 / 214987
lung 5 / 128150 6 / 170663 6 / 159917 2 / 159059 5 / 128150 6 / 170663 6 / 159917 2 / 159059
lymph node 5 / 62650 1 / 27007 222 / 5278419 486 / 4863489 5 / 62650 1 / 27007 222 / 5278419 486 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 5 / 104307 1174 / 43166038 2567 / 30312656 1 / 46553 5 / 104307 1174 / 43166038 2567 / 30312656
muscle 6 / 74039   2 / 107836 3 / 61270 6 / 74039 0 / 27691 2 / 107836 3 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 2 / 94887 6 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 2 / 94887 6 / 179472
pancreas   3 / 74930 3 / 85728 4 / 189999 0 / 7237 3 / 74930 3 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524 3 / 30072 -- -- 2 / 96524 3 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 1 / 241088 3 / 39531 11 / 207348 -- 1 / 241088 3 / 39531 11 / 207348 --
pooled tissue 7 / 276455   -- -- 7 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 6 / 107080 9 / 266949 11 / 491794 3 / 79993 6 / 107080 9 / 266949 11 / 491794
retina   -- 49 / 820326 29 / 88490 0 / 29438 -- 49 / 820326 29 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   1 / 125377 2303 / 26905847 2229 / 34522313 0 / 73633 1 / 125377 2303 / 26905847 2229 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 783 / 6230144 -- -- -- 783 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 2 / 65644 5 / 124767 33 / 448716 3 / 26641 2 / 65644 5 / 124767 33 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 6 / 143630 3 / 100058 -- 2127 / 12372003 6 / 143630 3 / 100058 -- 2127 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     8 / 115938 13 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 8 / 115938 13 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 15 / 479819   10 / 51729 2 / 207932 15 / 479819 0 / 21833 10 / 51729
uterus   5 / 133582 1250 / 10193077 -- 0 / 38063 5 / 133582 1250 / 10193077 --
vascular   -- 1140 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 1140 / 13135050 --
white blood cells -- -- 18 / 846268 -- -- -- 18 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --