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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.477481Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 259 / 3316537 612 / 2498449 1161 / 114162531 3680 / 109592465 259 / 3316537 612 / 2498449 1161 / 114162531 3680 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   8 / 57865 -- 3 / 83577 0 / 16077 8 / 57865 -- 3 / 83577
bone marrow 1 / 14774 3 / 29891 19 / 5047110 22 / 4978364 1 / 14774 3 / 29891 19 / 5047110 22 / 4978364
brain 46 / 506301 61 / 200215 9 / 729526 140 / 4997811 46 / 506301 61 / 200215 9 / 729526 140 / 4997811
cartilage 2 / 15965 4 / 37226 -- 7 / 778035 2 / 15965 4 / 37226 -- 7 / 778035
cerebellum 13 / 90353     97 / 1495938 13 / 90353 0 / 0 0 / 90885 97 / 1495938
cerebrum 3 / 198932   -- -- 3 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   20 / 44577 -- -- 0 / 3888 20 / 44577 -- --
colon   32 / 151167   69 / 643586 0 / 26551 32 / 151167 0 / 98089 69 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 58 / 246043   -- -- 58 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine   1 / 2857 -- -- 0 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 9 / 128826 23 / 46440 1 / 85898 1552 / 12434232 9 / 128826 23 / 46440 1 / 85898 1552 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 4 / 12721   -- 1 / 28803 4 / 12721 0 / 45908 --
heart 12 / 76442     -- 12 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 5 / 106627 15 / 89898 16 / 155372 16 / 100281 5 / 106627 15 / 89898 16 / 155372 16 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 7 / 107249   10 / 214987 2 / 96846 7 / 107249 0 / 66308 10 / 214987
lung 5 / 128150 32 / 170663 3 / 159917 3 / 159059 5 / 128150 32 / 170663 3 / 159917 3 / 159059
lymph node 23 / 62650 1 / 27007 82 / 5278419 43 / 4863489 23 / 62650 1 / 27007 82 / 5278419 43 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 28 / 44303 -- -- 1 / 17836 28 / 44303 -- --
mammary gland   11 / 104307 418 / 43166038 527 / 30312656 0 / 46553 11 / 104307 418 / 43166038 527 / 30312656
muscle 1 / 74039 29 / 27691   1 / 61270 1 / 74039 29 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   41 / 89988 16 / 94887 10 / 179472 0 / 11462 41 / 89988 16 / 94887 10 / 179472
pancreas   12 / 74930 1 / 85728 6 / 189999 0 / 7237 12 / 74930 1 / 85728 6 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 24 / 241088 22 / 39531 12 / 207348 -- 24 / 241088 22 / 39531 12 / 207348 --
pooled tissue 27 / 276455   -- -- 27 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 17 / 107080 2 / 266949 9 / 491794 3 / 79993 17 / 107080 2 / 266949 9 / 491794
retina   -- 4 / 820326 15 / 88490 0 / 29438 -- 4 / 820326 15 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 2 / 73633 38 / 125377 162 / 26905847 394 / 34522313 2 / 73633 38 / 125377 162 / 26905847 394 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 196 / 6230144 -- -- -- 196 / 6230144 --
stomach   6 / 65644   15 / 448716 0 / 26641 6 / 65644 0 / 124767 15 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 61 / 100058 -- 734 / 12372003 2 / 143630 61 / 100058 -- 734 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606     0 / 11737 1 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 16 / 207932 108 / 479819 1 / 21833 7 / 51729 16 / 207932 108 / 479819 1 / 21833 7 / 51729
uterus   21 / 133582 63 / 10193077 -- 0 / 38063 21 / 133582 63 / 10193077 --
vascular   -- 153 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 153 / 13135050 --
white blood cells -- -- 3 / 846268 -- -- -- 3 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --