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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.476636Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 275 / 3316537 103 / 2498449 4120 / 114162531 5899 / 109592465 275 / 3316537 103 / 2498449 4120 / 114162531 5899 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 1 / 57865 --   1 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   2 / 29891     0 / 14774 2 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 28 / 506301 9 / 200215 28 / 729526 152 / 4997811 28 / 506301 9 / 200215 28 / 729526 152 / 4997811
cartilage   4 / 37226 -- 2 / 778035 0 / 15965 4 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum 4 / 90353   5 / 90885 87 / 1495938 4 / 90353 0 / 0 5 / 90885 87 / 1495938
cerebrum 23 / 198932   -- -- 23 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 10 / 151167 1 / 98089 11 / 643586 1 / 26551 10 / 151167 1 / 98089 11 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 23 / 246043   -- -- 23 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 17 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 2266 / 12434232 17 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 2266 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 13 / 76442   3 / 83063 -- 13 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 11 / 106627 3 / 89898 2 / 155372   11 / 106627 3 / 89898 2 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 6 / 96846 1 / 107249   1 / 214987 6 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 8 / 128150 10 / 170663   1 / 159059 8 / 128150 10 / 170663 0 / 159917 1 / 159059
lymph node   3 / 27007 24 / 5278419   0 / 62650 3 / 27007 24 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 20 / 46553 7 / 104307 390 / 43166038 253 / 30312656 20 / 46553 7 / 104307 390 / 43166038 253 / 30312656
muscle 9 / 74039   1 / 107836 4 / 61270 9 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 4 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   7 / 89988 1 / 94887 1 / 179472 0 / 11462 7 / 89988 1 / 94887 1 / 179472
pancreas   3 / 74930     0 / 7237 3 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524 2 / 30072 -- -- 5 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891 1 / 645 -- -- 2 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland   1 / 1358 -- -- 0 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 13 / 241088   5 / 207348 -- 13 / 241088 0 / 39531 5 / 207348 --
pooled tissue 32 / 276455   -- -- 32 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 9 / 79993 1 / 107080   12 / 491794 9 / 79993 1 / 107080 0 / 266949 12 / 491794
retina 5 / 29438 -- 24 / 820326 10 / 88490 5 / 29438 -- 24 / 820326 10 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     1555 / 26905847 2635 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 1555 / 26905847 2635 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 13 / 52939   -- -- 13 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 667 / 6230144 -- -- -- 667 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 7 / 65644 3 / 124767 9 / 448716 1 / 26641 7 / 65644 3 / 124767 9 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 11 / 143630 1 / 100058 -- 446 / 12372003 11 / 143630 1 / 100058 -- 446 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 3 / 32606 7 / 115938 8 / 124664 2 / 11737 3 / 32606 7 / 115938 8 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932 19 / 479819   1 / 51729 3 / 207932 19 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 9 / 38063 5 / 133582 294 / 10193077 -- 9 / 38063 5 / 133582 294 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 1108 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 1108 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --