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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.476454Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 161 / 3316537 77 / 2498449 3403 / 114162531 2620 / 109592465 161 / 3316537 77 / 2498449 3403 / 114162531 2620 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774   30 / 5047110 18 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 30 / 5047110 18 / 4978364
brain 24 / 506301 12 / 200215 8 / 729526 143 / 4997811 24 / 506301 12 / 200215 8 / 729526 143 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 2 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum 5 / 90353   1 / 90885 28 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 1 / 90885 28 / 1495938
cerebrum 14 / 198932   -- -- 14 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon   3 / 151167   6 / 643586 0 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 6 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043   -- -- 3 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 10 / 128826     278 / 12434232 10 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 278 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803 2 / 12721   -- 4 / 28803 2 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442   1 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 18 / 106627 5 / 89898 1 / 155372   18 / 106627 5 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 5 / 107249 9 / 66308 7 / 214987 1 / 96846 5 / 107249 9 / 66308 7 / 214987
lung 2 / 128150 3 / 170663     2 / 128150 3 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node 2 / 62650   40 / 5278419 138 / 4863489 2 / 62650 0 / 27007 40 / 5278419 138 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 7 / 43166038 306 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 7 / 43166038 306 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas   2 / 74930   1 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 0 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524 3 / 30072 -- -- 1 / 96524 3 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 5 / 13260   -- -- 5 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088 2 / 39531 1 / 207348 -- 3 / 241088 2 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 26 / 276455   -- -- 26 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993 2 / 107080   3 / 491794 4 / 79993 2 / 107080 0 / 266949 3 / 491794
retina 5 / 29438 -- 19 / 820326 1 / 88490 5 / 29438 -- 19 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 8 / 73633 7 / 125377 2752 / 26905847 1512 / 34522313 8 / 73633 7 / 125377 2752 / 26905847 1512 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 11 / 52939   -- -- 11 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 95 / 6230144 -- -- -- 95 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 1 / 65644   3 / 448716 1 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 3 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 4 / 100058 -- 137 / 12372003 5 / 143630 4 / 100058 -- 137 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     31 / 115938 36 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 31 / 115938 36 / 124664
uncharacterized tissue 4 / 207932 12 / 479819   1 / 51729 4 / 207932 12 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 1 / 38063 1 / 133582 132 / 10193077 -- 1 / 38063 1 / 133582 132 / 10193077 --
vascular   -- 271 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 271 / 13135050 --
white blood cells -- -- 5 / 846268 -- -- -- 5 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --