Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.476358Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 32 / 3316537 46 / 2498449 47 / 114162531 191 / 109592465 32 / 3316537 46 / 2498449 47 / 114162531 191 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 2 / 57865 --   1 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow       10 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 10 / 4978364
brain 8 / 506301 1 / 200215 2 / 729526 5 / 4997811 8 / 506301 1 / 200215 2 / 729526 5 / 4997811
cartilage     --   0 / 15965 0 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 3 / 90353   1 / 90885 1 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 1 / 90885 1 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   12 / 151167     0 / 26551 12 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 2 / 128826     9 / 12434232 2 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 9 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442     -- 1 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 1 / 106627 1 / 89898     1 / 106627 1 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung   16 / 170663     0 / 128150 16 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node         0 / 62650 0 / 27007 0 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 1 / 104307 2 / 43166038 131 / 30312656 1 / 46553 1 / 104307 2 / 43166038 131 / 30312656
muscle 1 / 74039       1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas   1 / 74930     0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524 4 / 30072 -- -- 4 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland   1 / 1358 -- -- 0 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 1 / 241088     -- 1 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 1 / 276455   -- -- 1 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 1 / 107080     1 / 79993 1 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina 1 / 29438 -- 5 / 820326   1 / 29438 -- 5 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     7 / 26905847 34 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 7 / 26905847 34 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 6230144 --
stomach   2 / 65644   1 / 448716 0 / 26641 2 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     --   0 / 143630 0 / 100058 -- 0 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606     0 / 11737 1 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue   2 / 479819     0 / 207932 2 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   1 / 133582 30 / 10193077 -- 0 / 38063 1 / 133582 30 / 10193077 --
vascular   --   -- 0 / 46250 -- 0 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --