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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.473296Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 603 / 3316537 492 / 2498449 7433 / 114162531 2224 / 109592465 603 / 3316537 492 / 2498449 7433 / 114162531 2224 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 9 / 57865 -- 25 / 83577 1 / 16077 9 / 57865 -- 25 / 83577
bone marrow 1 / 14774 5 / 29891 19 / 5047110 73 / 4978364 1 / 14774 5 / 29891 19 / 5047110 73 / 4978364
brain 102 / 506301 45 / 200215 55 / 729526 208 / 4997811 102 / 506301 45 / 200215 55 / 729526 208 / 4997811
cartilage 12 / 15965 7 / 37226 -- 81 / 778035 12 / 15965 7 / 37226 -- 81 / 778035
cerebellum 13 / 90353   10 / 90885 35 / 1495938 13 / 90353 0 / 0 10 / 90885 35 / 1495938
cerebrum 52 / 198932   -- -- 52 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   14 / 44577 -- -- 0 / 3888 14 / 44577 -- --
colon 5 / 26551 31 / 151167 2 / 98089 89 / 643586 5 / 26551 31 / 151167 2 / 98089 89 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 45 / 246043   -- -- 45 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   5 / 17290 -- -- 0 / 270 5 / 17290 -- --
eye 17 / 128826 9 / 46440 5 / 85898 79 / 12434232 17 / 128826 9 / 46440 5 / 85898 79 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803 3 / 12721 2 / 45908 -- 3 / 28803 3 / 12721 2 / 45908 --
heart 15 / 76442   2 / 83063 -- 15 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 56 / 106627 18 / 89898 6 / 155372 9 / 100281 56 / 106627 18 / 89898 6 / 155372 9 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 7 / 96846 29 / 107249   9 / 214987 7 / 96846 29 / 107249 0 / 66308 9 / 214987
lung 8 / 128150 24 / 170663 16 / 159917 22 / 159059 8 / 128150 24 / 170663 16 / 159917 22 / 159059
lymph node 3 / 62650   77 / 5278419   3 / 62650 0 / 27007 77 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 5 / 46553 20 / 104307 6495 / 43166038 929 / 30312656 5 / 46553 20 / 104307 6495 / 43166038 929 / 30312656
muscle 7 / 74039 10 / 27691 7 / 107836 4 / 61270 7 / 74039 10 / 27691 7 / 107836 4 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 8 / 89988 11 / 94887 27 / 179472 1 / 11462 8 / 89988 11 / 94887 27 / 179472
pancreas 1 / 7237 15 / 74930 15 / 85728 26 / 189999 1 / 7237 15 / 74930 15 / 85728 26 / 189999
pancreatic islet 13 / 96524   -- -- 13 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system 4 / 14891   -- -- 4 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 24 / 241088 9 / 39531 3 / 207348 -- 24 / 241088 9 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 29 / 276455   -- -- 29 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 21 / 79993 21 / 107080 9 / 266949 32 / 491794 21 / 79993 21 / 107080 9 / 266949 32 / 491794
retina 4 / 29438 -- 12 / 820326 1 / 88490 4 / 29438 -- 12 / 820326 1 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 31 / 73633 29 / 125377 165 / 26905847 274 / 34522313 31 / 73633 29 / 125377 165 / 26905847 274 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 10 / 52939   -- -- 10 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 131 / 6230144 -- -- -- 131 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 15 / 65644   34 / 448716 3 / 26641 15 / 65644 0 / 124767 34 / 448716
synovium 1 / 249   -- -- 1 / 249 0 / 1650 -- --
testis 9 / 143630 19 / 100058 -- 262 / 12372003 9 / 143630 19 / 100058 -- 262 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 3 / 32606   1 / 124664 1 / 11737 3 / 32606 0 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 46 / 207932 110 / 479819 2 / 21833 4 / 51729 46 / 207932 110 / 479819 2 / 21833 4 / 51729
uterus 7 / 38063 25 / 133582 128 / 10193077 -- 7 / 38063 25 / 133582 128 / 10193077 --
vascular 36 / 46250 -- 203 / 13135050 -- 36 / 46250 -- 203 / 13135050 --
white blood cells -- -- 58 / 846268 -- -- -- 58 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --