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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.472409Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 129 / 3316537 206 / 2498449 1426 / 114162531 1540 / 109592465 129 / 3316537 206 / 2498449 1426 / 114162531 1540 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 2 / 57865 -- 1 / 83577 3 / 16077 2 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow     4 / 5047110 7 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 4 / 5047110 7 / 4978364
brain 11 / 506301 19 / 200215 4 / 729526 135 / 4997811 11 / 506301 19 / 200215 4 / 729526 135 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 18 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 18 / 778035
cerebellum 1 / 90353     28 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 0 / 90885 28 / 1495938
cerebrum 4 / 198932   -- -- 4 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon   22 / 151167 1 / 98089 9 / 643586 0 / 26551 22 / 151167 1 / 98089 9 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 21 / 246043   -- -- 21 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 6 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 112 / 12434232 6 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 112 / 12434232
gastrointestinal tract   1 / 12721 1 / 45908 -- 0 / 28803 1 / 12721 1 / 45908 --
heart 4 / 76442   2 / 83063 -- 4 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 6 / 106627 10 / 89898 2 / 155372 3 / 100281 6 / 106627 10 / 89898 2 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 1 / 107249 5 / 66308 2 / 214987 3 / 96846 1 / 107249 5 / 66308 2 / 214987
lung 4 / 128150 22 / 170663 3 / 159917 2 / 159059 4 / 128150 22 / 170663 3 / 159917 2 / 159059
lymph node 1 / 62650 1 / 27007 29 / 5278419 6 / 4863489 1 / 62650 1 / 27007 29 / 5278419 6 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 1 / 44303 -- -- 1 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 3 / 104307 258 / 43166038 588 / 30312656 2 / 46553 3 / 104307 258 / 43166038 588 / 30312656
muscle 1 / 74039 2 / 27691   1 / 61270 1 / 74039 2 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   17 / 89988 6 / 94887 6 / 179472 0 / 11462 17 / 89988 6 / 94887 6 / 179472
pancreas   12 / 74930 1 / 85728 3 / 189999 0 / 7237 12 / 74930 1 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524   -- -- 5 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260 1 / 1358 -- -- 1 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 9 / 241088   6 / 207348 -- 9 / 241088 0 / 39531 6 / 207348 --
pooled tissue 14 / 276455   -- -- 14 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 11 / 79993 19 / 107080 4 / 266949 11 / 491794 11 / 79993 19 / 107080 4 / 266949 11 / 491794
retina 2 / 29438 -- 6 / 820326   2 / 29438 -- 6 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 2 / 73633 13 / 125377 502 / 26905847 382 / 34522313 2 / 73633 13 / 125377 502 / 26905847 382 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 64 / 6230144 -- -- -- 64 / 6230144 --
stomach   7 / 65644 1 / 124767 6 / 448716 0 / 26641 7 / 65644 1 / 124767 6 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 7 / 143630 8 / 100058 -- 212 / 12372003 7 / 143630 8 / 100058 -- 212 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   3 / 32606 7 / 115938 5 / 124664 0 / 11737 3 / 32606 7 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 5 / 207932 25 / 479819   3 / 51729 5 / 207932 25 / 479819 0 / 21833 3 / 51729
uterus 1 / 38063 10 / 133582 210 / 10193077 -- 1 / 38063 10 / 133582 210 / 10193077 --
vascular 3 / 46250 -- 303 / 13135050 -- 3 / 46250 -- 303 / 13135050 --
white blood cells -- -- 6 / 846268 -- -- -- 6 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --