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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.471955Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 22 / 3316537 30 / 2498449 2294 / 114162531 896 / 109592465 22 / 3316537 30 / 2498449 2294 / 114162531 896 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     -- 4 / 83577 0 / 16077 0 / 57865 -- 4 / 83577
bone marrow     41 / 5047110 10 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 41 / 5047110 10 / 4978364
brain 1 / 506301 6 / 200215 41 / 729526 135 / 4997811 1 / 506301 6 / 200215 41 / 729526 135 / 4997811
cartilage     -- 6 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum     1 / 90885 26 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 26 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   2 / 151167   6 / 643586 0 / 26551 2 / 151167 0 / 98089 6 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 4 / 128826 2 / 46440 2 / 85898 213 / 12434232 4 / 128826 2 / 46440 2 / 85898 213 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803   2 / 45908 -- 2 / 28803 0 / 12721 2 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney     3 / 155372   0 / 106627 0 / 89898 3 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846       1 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 1 / 128150 11 / 170663   5 / 159059 1 / 128150 11 / 170663 0 / 159917 5 / 159059
lymph node     12 / 5278419 6 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 12 / 5278419 6 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   2 / 104307 1645 / 43166038 316 / 30312656 0 / 46553 2 / 104307 1645 / 43166038 316 / 30312656
muscle   1 / 27691     0 / 74039 1 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 1 / 89988   2 / 179472 2 / 11462 1 / 89988 0 / 94887 2 / 179472
pancreas       5 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 5 / 189999
pancreatic islet   1 / 30072 -- -- 0 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 1 / 241088   1 / 207348 -- 1 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 1 / 276455   -- -- 1 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993   4 / 266949 4 / 491794 5 / 79993 0 / 107080 4 / 266949 4 / 491794
retina   -- 11 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 11 / 820326 1 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin     126 / 26905847 107 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 126 / 26905847 107 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 9 / 6230144 -- -- -- 9 / 6230144 --
stomach   1 / 65644   1 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630   -- 45 / 12372003 2 / 143630 0 / 100058 -- 45 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737     4 / 124664 1 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 4 / 124664
uncharacterized tissue   1 / 479819     0 / 207932 1 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   1 / 133582 361 / 10193077 -- 0 / 38063 1 / 133582 361 / 10193077 --
vascular   -- 28 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 28 / 13135050 --
white blood cells -- -- 6 / 846268 -- -- -- 6 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --